IFI16

IFI16
Наявні структури
PDB	Пошук для людей: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2OQ0, 3B6Y, 3RLN, 3RLO, 3RNU, 4QGU
Ідентифікатори
Символи	IFI16, IFNGIP1, PYHIN2, interferon gamma inducible protein 16
Зовнішні ІД	OMIM: 147586 MGI: 3695276 HomoloGene: 115929 GeneCards: IFI16
Пов'язані генетичні захворювання
	ревматоїдний артрит, целіакія
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • identical protein binding; • double-stranded DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • DNA binding; • transcription factor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• ядерце; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • мембрана; • nuclear speck; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• positive regulation of type I interferon production; • GO:0032737 positive regulation of cytokine production; • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator; • cellular response to glucose starvation; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of viral genome replication; • negative regulation of innate immune response; • monocyte differentiation; • cellular response to ionizing radiation; • negative regulation of DNA binding; • regulation of autophagy; • myeloid cell differentiation; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • GO:0097285 апоптоз; • кровотворення; • activation of cysteine-type endopeptidase activity; • автофагія; • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of interleukin-1 beta production; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • Епігенетичне успадкування; • проліферація; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • activation of innate immune response; • процес імунної системи; • inflammatory response; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • вроджений імунітет; • defense response to virus; • cellular response to interferon-beta;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	3428
	623121
	ENSG00000163565
	ENSMUSG00000073491
	Q16666
	н/д
NM_001206567; NM_005531; NM_001364867; NM_001376587; NM_001376588;
	NM_001376589; NM_001376591; NM_001376592
	NM_001033384; NM_001177349; NM_001177350; NM_001368798; NM_001368799
NP_001193496; NP_005522; NP_001351796; NP_001363516; NP_001363517;
	NP_001363518; NP_001363520; NP_001363521
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

IFI16 (англ. Interferon gamma inducible protein 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 785 амінокислот, а молекулярна маса — 88 256^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGKKYKNIVL	LKGLEVINDY	HFRMVKSLLS	NDLKLNLKMR	EEYDKIQIAD
LMEEKFRGDA	GLGKLIKIFE	DIPTLEDLAE	TLKKEKLKVK	GPALSRKRKK
EVDATSPAPS	TSSTVKTEGA	EATPGAQKRK	KSTKEKAGPK	GSKVSEEQTQ
PPSPAGAGMS	TAMGRSPSPK	TSLSAPPNSS	STENPKTVAK	CQVTPRRNVL
QKRPVIVKVL	STTKPFEYET	PEMEKKIMFH	ATVATQTQFF	HVKVLNTSLK
EKFNGKKIII	ISDYLEYDSL	LEVNEESTVS	EAGPNQTFEV	PNKIINRAKE
TLKIDILHKQ	ASGNIVYGVF	MLHKKTVNQK	TTIYEIQDDR	GKMDVVGTGQ
CHNIPCEEGD	KLQLFCFRLR	KKNQMSKLIS	EMHSFIQIKK	KTNPRNNDPK
SMKLPQEQRQ	LPYPSEASTT	FPESHLRTPQ	MPPTTPSSSF	FTKKSEDTIS
KMNDFMRMQI	LKEGSHFPGP	FMTSIGPAES	HPHTPQMPPS	TPSSSFLTTK
SEDTISKMND	FMRMQILKEG	SHFPGPFMTS	IGPAESHPHT	PQMPPSTPSS
SFLTTLKPRL	KTEPEEVSIE	DSAQSDLKEV	MVLNATESFV	YEPKEQKKMF
HATVATENEV	FRVKVFNIDL	KEKFTPKKII	AIANYVCRNG	FLEVYPFTLV
ADVNADRNME	IPKGLIRSAS	VTPKINQLCS	QTKGSFVNGV	FEVHKKNVRG
EFTYYEIQDN	TGKMEVVVHG	RLTTINCEEG	DKLKLTCFEL	APKSGNTGEL
RSVIHSHIKV	IKTRKNKKDI	LNPDSSMETS	PDFFF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь, автофагія, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Trapani J.A., Dawson M.J., Apostolidis V.A., Browne K.A. (1994). Genomic organization of IFI16, an interferon-inducible gene whose expression is associated with human myeloid cell differentiation: correlation of predicted protein domains with exon organization. Immunogenetics. 40: 415—424. PMID 7959953 DOI:10.1007/BF00177824
Xin H., Curry J., Johnstone R.W., Nickoloff B.J., Choubey D. (2003). Role of IFI 16, a member of the interferon-inducible p200-protein family, in prostate epithelial cellular senescence. Oncogene. 22: 4831—4840. PMID 12894224 DOI:10.1038/sj.onc.1206754
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Johnstone R.W., Kershaw M.H., Trapani J.A. (1998). Isotypic variants of the interferon-inducible transcriptional repressor IFI 16 arise through differential mRNA splicing. Biochemistry. 37: 11924—11931. PMID 9718316 DOI:10.1021/bi981069a
Dawson M.J., Trapani J.A. (1995). IFI 16 gene encodes a nuclear protein whose expression is induced by interferons in human myeloid leukaemia cell lines. J. Cell. Biochem. 57: 39—51. PMID 7536752 DOI:10.1002/jcb.240570106
Johnstone R.W., Kerry J.A., Trapani J.A. (1998). The human interferon-inducible protein, IFI 16, is a repressor of transcription. J. Biol. Chem. 273: 17172—17177. PMID 9642285 DOI:10.1074/jbc.273.27.17172