HEXIM1

HEXIM1 (англ. Hexamethylene bisacetamide inducible 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 40 623.

HEXIM1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2GD7, 3S9G
Ідентифікатори
Символи	HEXIM1, CLP1, EDG1, HIS1, MAQ1, hexamethylene bis-acetamide inducible 1, hexamethylene bisacetamide inducible 1, HEXIM P-TEFb complex subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607328 MGI: 2385923 HomoloGene: 31382 GeneCards: HEXIM1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • snRNA binding • 7SK snRNA binding • cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • цитоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • positive regulation of signal transduction by p53 class mediator • heart development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • activation of innate immune response • процес імунної системи • вроджений імунітет Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10614	192231
Ensembl	ENSG00000186834	ENSMUSG00000048878
UniProt	O94992	Q8R409
RefSeq (мРНК)	NM_006460	NM_138753
RefSeq (білок)	NP_006451	NP_620092
Локус (UCSC)	Хр. 17: 45.15 – 45.15 Mb	Хр. 11: 103.01 – 103.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEPFLSEYQ		HQPQTSNCTG		AAAVQEELNP		ERPPGAEERV		PEEDSRWQSR
AFPQLGGRPG		PEGEGSLESQ		PPPLQTQACP		ESSCLREGEK		GQNGDDSSAG
GDFPPPAEVE		PTPEAELLAQ		PCHDSEASKL		GAPAAGGEEE		WGQQQRQLGK
KKHRRRPSKK		KRHWKPYYKL		TWEEKKKFDE		KQSLRASRIR		AEMFAKGQPV
APYNTTQFLM		DDHDQEEPDL		KTGLYSKRAA		AKSDDTSDDD		FMEEGGEEDG
GSDGMGGDGS		EFLQRDFSET		YERYHTESLQ		NMSKQELIKE		YLELEKCLSR
MEDENNRLRL		ESKRLGGDDA		RVRELELELD		RLRAENLQLL		TENELHRQQE
RAPLSKFGD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yik J.H.N., Chen R., Pezda A.C., Samford C.S., Zhou Q. (2004). A human immunodeficiency virus type 1 Tat-like arginine-rich RNA-binding domain is essential for HEXIM1 to inhibit RNA polymerase II transcription through 7SK snRNA-mediated inactivation of P-TEFb. Mol. Cell. Biol. 24: 5094—5105. PMID 15169877 DOI:10.1128/MCB.24.12.5094-5105.2004
• Yik J.H.N., Chen R., Pezda A.C., Zhou Q. (2005). Compensatory contributions of HEXIM1 and HEXIM2 in maintaining the balance of active and inactive positive transcription elongation factor b complexes for control of transcription. J. Biol. Chem. 280: 16368—16376. PMID 15713661 DOI:10.1074/jbc.M500912200
• Blazek D., Barboric M., Kohoutek J., Oven I., Peterlin B.M. (2005). Oligomerization of HEXIM1 via 7SK snRNA and coiled-coil region directs the inhibition of P-TEFb. Nucleic Acids Res. 33: 7000—7010. PMID 16377779 DOI:10.1093/nar/gki997
• Wittmann B.M., Fujinaga K., Deng H., Ogba N., Montano M.M. (2005). The breast cell growth inhibitor, estrogen down regulated gene 1, modulates a novel functional interaction between estrogen receptor alpha and transcriptional elongation factor cyclin T1. Oncogene. 24: 5576—5588. PMID 15940264 DOI:10.1038/sj.onc.1208728
• Kohoutek J., Blazek D., Peterlin B.M. (2006). Hexim1 sequesters positive transcription elongation factor b from the class II transactivator on MHC class II promoters. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 17349—17354. PMID 17088550 DOI:10.1073/pnas.0603079103

Див. також

• Хромосома 17