HDC

HDC (англ. Histidine decarboxylase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 662 амінокислот, а молекулярна маса — 74 141.

HDC
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4E1O
Ідентифікатори
Символи	HDC, entrez:3067, Histidine decarboxylase
Зовнішні ІД	OMIM: 142704 MGI: 96062 HomoloGene: 20490 GeneCards: HDC
Онтологія гена Молекулярна функція • pyridoxal phosphate binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histidine decarboxylase activity • каталітична активність • carboxy-lyase activity • lyase activity Клітинна компонента • гіалоплазма Біологічний процес • cellular amino acid metabolic process • catecholamine biosynthetic process • histidine metabolic process • carboxylic acid metabolic process • histidine catabolic process • histamine biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3067	15186
Ensembl	ENSG00000140287	ENSMUSG00000027360
UniProt	P19113	P23738
RefSeq (мРНК)	NM_001306146 NM_002112	NM_008230
RefSeq (білок)	NP_001293075 NP_002103	NP_032256
Локус (UCSC)	Хр. 15: 50.24 – 50.27 Mb	Хр. 2: 126.44 – 126.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMEPEEYRER		GREMVDYICQ		YLSTVRERRV		TPDVQPGYLR		AQLPESAPED
PDSWDSIFGD		IERIIMPGVV		HWQSPHMHAY		YPALTSWPSL		LGDMLADAIN
CLGFTWASSP		ACTELEMNVM		DWLAKMLGLP		EHFLHHHPSS		QGGGVLQSTV
SESTLIALLA		ARKNKILEMK		TSEPDADESC		LNARLVAYAS		DQAHSSVEKA
GLISLVKMKF		LPVDDNFSLR		GEALQKAIEE		DKQRGLVPVF		VCATLGTTGV
CAFDCLSELG		PICAREGLWL		HIDAAYAGTA		FLCPEFRGFL		KGIEYADSFT
FNPSKWMMVH		FDCTGFWVKD		KYKLQQTFSV		NPIYLRHANS		GVATDFMHWQ
IPLSRRFRSV		KLWFVIRSFG		VKNLQAHVRH		GTEMAKYFES		LVRNDPSFEI
PAKRHLGLVV		FRLKGPNCLT		ENVLKEIAKA		GRLFLIPATI		QDKLIIRFTV
TSQFTTRDDI		LRDWNLIRDA		ATLILSQHCT		SQPSPRVGNL		ISQIRGARAW
ACGTSLQSVS		GAGDDPVQAR		KIIKQPQRVG		AGPMKRENGL		HLETLLDPVD
DCFSEEAPDA		TKHKLSSFLF		SYLSVQTKKK		TVRSLSCNSV		PVSAQKPLPT
EASVKNGGSS		RVRIFSRFPE		DMMMLKKSAF		KKLIKFYSVP		SFPECSSQCG
LQLPCCPLQA		MV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, декарбоксилаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом.

Література

• Zahnow C.A., Yi H.F., McBride O.W., Joseph D.R. (1991). Cloning of the cDNA encoding human histidine decarboxylase from an erythroleukemia cell line and mapping of the gene locus to chromosome 15. DNA Seq. 1: 395—400. PMID 1768863 DOI:10.3109/10425179109020795
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Komori H., Nitta Y., Ueno H., Higuchi Y. (2012). Structural study reveals that Ser-354 determines substrate specificity on human histidine decarboxylase. J. Biol. Chem. 287: 29175—29183. PMID 22767596 DOI:10.1074/jbc.M112.381897

Див. також

• Хромосома 15