HDAC11

HDAC11
Ідентифікатори
Символи	HDAC11, HD11, histone deacetylase 11
Зовнішні ІД	OMIM: 607226 MGI: 2385252 HomoloGene: 11743 GeneCards: HDAC11
Реагує на сполуку
	quisinostat, золінза, entinostat, cudc-101, cudc-907, tacedinaline
Онтологія гена
Молекулярна функція	• NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific); • transcription factor binding; • hydrolase activity; • histone deacetylase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• histone deacetylase complex; • клітинна мембрана; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• histone H3 deacetylation; • oligodendrocyte development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • histone deacetylation; • transcription, DNA-templated; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	79885
	232232
	ENSG00000163517
	ENSMUSG00000034245
	Q96DB2
	Q91WA3
	NM_001136041; NM_024827; NM_001330636
	NM_144919
	NP_001129513; NP_001317565; NP_079103
	NP_659168
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HDAC11 (англ. Histone deacetylase 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 347 амінокислот, а молекулярна маса — 39 183^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLHTTQLYQH	VPETRWPIVY	SPRYNITFMG	LEKLHPFDAG	KWGKVINFLK
EEKLLSDSML	VEAREASEED	LLVVHTRRYL	NELKWSFAVA	TITEIPPVIF
LPNFLVQRKV	LRPLRTQTGG	TIMAGKLAVE	RGWAINVGGG	FHHCSSDRGG
GFCAYADITL	AIKFLFERVE	GISRATIIDL	DAHQGNGHER	DFMDDKRVYI
MDVYNRHIYP	GDRFAKQAIR	RKVELEWGTE	DDEYLDKVER	NIKKSLQEHL
PDVVVYNAGT	DILEGDRLGG	LSISPAGIVK	RDELVFRMVR	GRRVPILMVT
SGGYQKRTAR	IIADSILNLF	GLGLIGPESP	SVSAQNSDTP	LLPPAVP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Gao L., Cueto M.A., Asselbergs F., Atadja P. (2002). Cloning and functional characterization of HDAC11, a novel member of the human histone deacetylase family. J. Biol. Chem. 277: 25748—25755. PMID 11948178 DOI:10.1074/jbc.M111871200