GRAMD1A

GRAMD1A (англ. GRAM domain containing 1A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 724 амінокислот, а молекулярна маса — 80 680.

GRAMD1A
Ідентифікатори
Символи	GRAMD1A, KIAA1533, GRAM domain containing 1A, Aster-A
Зовнішні ІД	MGI: 105490 HomoloGene: 10843 GeneCards: GRAMD1A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cholesterol binding • GO:0017127 cholesterol transfer activity • lipid binding Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • intrinsic component of endoplasmic reticulum membrane • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • organelle membrane contact site • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum membrane • клітинна мембрана • endoplasmic reticulum-plasma membrane contact site Біологічний процес • cholesterol transport • cellular response to cholesterol • intermembrane sterol transfer • lipid transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57655	52857
Ensembl	ENSG00000089351	ENSMUSG00000001248
UniProt	Q96CP6	Q8VEF1
RefSeq (мРНК)	NM_001136199 NM_020895 NM_001320034 NM_001320035 NM_001320036	NM_027898 NM_001360351
RefSeq (білок)	NP_001129671 NP_001306963 NP_001306964 NP_001306965 NP_065946	NP_082174 NP_001347280
Локус (UCSC)	Хр. 19: 34.99 – 35.03 Mb	Хр. 7: 30.83 – 30.86 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFDTTPHSGR		STPSSSPSLR		KRLQLLPPSR		PPPEPEPGTM		VEKGSDSSSE
KGGVPGTPST		QSLGSRNFIR		NSKKMQSWYS		MLSPTYKQRN		EDFRKLFSKL
PEAERLIVDY		SCALQREILL		QGRLYLSENW		ICFYSNIFRW		ETTISIQLKE
VTCLKKEKTA		KLIPNAIQIC		TESEKHFFTS		FGARDRCFLL		IFRLWQNALL
EKTLSPRELW		HLVHQCYGSE		LGLTSEDEDY		VSPLQLNGLG		TPKEVGDVIA
LSDITSSGAA		DRSQEPSPVG		SRRGHVTPNL		SRASSDADHG		AEEDKEEQVD
SQPDASSSQT		VTPVAEPPST		EPTQPDGPTT		LGPLDLLPSE		ELLTDTSNSS
SSTGEEADLA		ALLPDLSGRL		LINSVFHVGA		ERLQQMLFSD		SPFLQGFLQQ
CKFTDVTLSP		WSGDSKCHQR		RVLTYTIPIS		NPLGPKSASV		VETQTLFRRG
PQAGGCVVDS		EVLTQGIPYQ		DYFYTAHRYC		ILGLARNKAR		LRVSSEIRYR
KQPWSLVKSL		IEKNSWSGIE		DYFHHLEREL		AKAEKLSLEE		GGKDARGLLS
GLRRRKRPLS		WRAHGDGPQH		PDPDPCARAG		IHTSGSLSSR		FSEPSVDQGP
GAGIPSALVL		ISIVICVSLI		ILIALNVLLF		YRLWSLERTA		HTFESWHSLA
LAKGKFPQTA		TEWAEILALQ		KQFHSVEVHK		WRQILRASVE		LLDEMKFSLE
KLHQGITVSD		PPFDTQPRPD		DSFS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 DOI:10.1093/dnares/7.2.143

Див. також

• Хромосома 19