GNPDA1

GNPDA1 (англ. Glucosamine-6-phosphate deaminase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 289 амінокислот, а молекулярна маса — 32 669.

GNPDA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1NE7
Ідентифікатори
Символи	GNPDA1, GNP1, GNPDA, GNPI, GPI, HLN, glucosamine-6-phosphate deaminase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601798 MGI: 1347054 HomoloGene: 38054 GeneCards: GNPDA1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • glucosamine-6-phosphate deaminase activity • identical protein binding Клітинна компонента • екзосома • гіалоплазма • цитоплазма Біологічний процес • N-acetylglucosamine metabolic process • generation of precursor metabolites and energy • single fertilization • glucosamine catabolic process • carbohydrate metabolic process • N-acetylglucosamine catabolic process • UDP-N-acetylglucosamine biosynthetic process • N-acetylneuraminate catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10007	26384
Ensembl	ENSG00000113552	ENSMUSG00000052102
UniProt	P46926	O88958
RefSeq (мРНК)	NM_005471	NM_011937
RefSeq (білок)	NP_005462	NP_036067
Локус (UCSC)	Хр. 5: 141.99 – 142.01 Mb	Хр. 18: 38.46 – 38.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKLIILEHYS		QASEWAAKYI		RNRIIQFNPG		PEKYFTLGLP		TGSTPLGCYK
KLIEYYKNGD		LSFKYVKTFN		MDEYVGLPRD		HPESYHSFMW		NNFFKHIDIH
PENTHILDGN		AVDLQAECDA		FEEKIKAAGG		IELFVGGIGP		DGHIAFNEPG
SSLVSRTRVK		TLAMDTILAN		ARFFDGELTK		VPTMALTVGV		GTVMDAREVM
ILITGAHKAF		ALYKAIEEGV		NHMWTVSAFQ		QHPRTVFVCD		EDATLELKVK
TVKYFKGLML		VHNKLVDPLY		SIKEKETEKS		QSSKKPYSD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як вуглеводний обмін, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Shevchenko V., Hogben M., Ekong R., Parrington J., Lai F.A. (1998). The human glucosamine-6-phosphate deaminase gene: cDNA cloning and expression, genomic organization and chromosomal localization. Gene. 216: 31—38. PMID 9714720 DOI:10.1016/S0378-1119(98)00335-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Arreola R., Valderrama B., Morante M.L., Horjales E. (2003). Two mammalian glucosamine-6-phosphate deaminases: a structural and genetic study. FEBS Lett. 551: 63—70. PMID 12965206 DOI:10.1016/S0014-5793(03)00896-2

Див. також

• Хромосома 5