GMDS

GMDS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1T2A
Ідентифікатори
Символи	GMDS, GMD, SDR3E1, GDP-mannose 4,6-dehydratase
Зовнішні ІД	OMIM: 602884 MGI: 1891112 HomoloGene: 75968 GeneCards: GMDS
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • NADP+ binding; • lyase activity; • GDP-mannose 4,6-dehydratase activity; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • екзосома; • цитоплазма;
Біологічний процес	• GDP-mannose metabolic process; • 'de novo' GDP-L-fucose biosynthetic process; • Сигнальний шлях Notch;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2762
	218138
	ENSG00000112699
	ENSMUSG00000038372
	O60547
	Q8K0C9
	NM_001253846; NM_001500
	NM_146041
	NP_001240775; NP_001491
	NP_666153
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GMDS (англ. GDP-mannose 4,6-dehydratase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 41 950^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAHAPARCPS	ARGSGDGEMG	KPRNVALITG	ITGQDGSYLA	EFLLEKGYEV
HGIVRRSSSF	NTGRIEHLYK	NPQAHIEGNM	KLHYGDLTDS	TCLVKIINEV
KPTEIYNLGA	QSHVKISFDL	AEYTADVDGV	GTLRLLDAVK	TCGLINSVKF
YQASTSELYG	KVQEIPQKET	TPFYPRSPYG	AAKLYAYWIV	VNFREAYNLF
AVNGILFNHE	SPRRGANFVT	RKISRSVAKI	YLGQLECFSL	GNLDAKRDWG
HAKDYVEAMW	LMLQNDEPED	FVIATGEVHS	VREFVEKSFL	HIGKTIVWEG
KNENEVGRCK	ETGKVHVTVD	LKYYRPTEVD	FLQGDCTKAK	QKLNWKPRVA
FDELVREMVH	ADVELMRTNP	NA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ліаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з НАДФ.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504