GLIS1

GLIS1 (англ. GLIS family zinc finger 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 620 амінокислот, а молекулярна маса — 65 976.

GLIS1
Ідентифікатори
Символи	GLIS1, GLIS family zinc finger 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610378 MGI: 2386723 HomoloGene: 77390 GeneCards: GLIS1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • osteoblast differentiation • negative regulation of cell fate commitment • fat cell differentiation • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	148979	230587
Ensembl	ENSG00000174332	ENSMUSG00000034762
UniProt	Q8NBF1	Q8K1M4
RefSeq (мРНК)	NM_147193 NM_001367484 NM_001390836 NM_001390837 NM_001390838	NM_147221
RefSeq (білок)	NP_671726 NP_001354413	NP_671754
Локус (UCSC)	Хр. 1: 53.51 – 53.74 Mb	Хр. 4: 107.29 – 107.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEARTSLSA		HCRGPLATGL		HPDLDLPGRS		LATPAPSCYL		LGSEPSSGLG
LQPETHLPEG		SLKRCCVLGL		PPTSPASSSP		CASSDVTSII		RSSQTSLVTC
VNGLRSPPLT		GDLGGPSKRA		RPGPASTDSH		EGSLQLEACR		KASFLKQEPA
DEFSELFGPH		QQGLPPPYPL		SQLPPGPSLG		GLGLGLAGRV		VAGRQACRWV
DCCAAYEQQE		ELVRHIEKSH		IDQRKGEDFT		CFWAGCVRRY		KPFNARYKLL
IHMRVHSGEK		PNKCMFEGCS		KAFSRLENLK		IHLRSHTGEK		PYLCQHPGCQ
KAFSNSSDRA		KHQRTHLDTK		PYACQIPGCS		KRYTDPSSLR		KHVKAHSAKE
QQVRKKLHAG		PDTEADVLTE		CLVLQQLHTS		TQLAASDGKG		GCGLGQELLP
GVYPGSITPH		NGLASGLLPP		AHDVPSRHHP		LDATTSSHHH		LSPLPMAEST
RDGLGPGLLS		PIVSPLKGLG		PPPLPPSSQS		HSPGGQPFPT		LPSKPSYPPF
QSPPPPPLPS		PQGYQGSFHS		IQSCFPYGDC		YRMAEPAAGG		DGLVGETHGF
NPLRPNGYHS		LSTPLPATGY		EALAEASCPT		ALPQQPSEDV		VSSGPEDCGF
FPNGAFDHCL		GHIPSIYTDT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1