GEMIN5
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
GEMIN5 (англ. Gem nuclear organelle associated protein 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 508 амінокислот, а молекулярна маса — 168 589[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MGQEPRTLPP | SPNWYCARCS | DAVPGGLFGF | AARTSVFLVR | VGPGAGESPG | ||||
TPPFRVIGEL | VGHTERVSGF | TFSHHPGQYN | LCATSSDDGT | VKIWDVETKT | ||||
VVTEHALHQH | TISTLHWSPR | VKDLIVSGDE | KGVVFCYWFN | RNDSQHLFIE | ||||
PRTIFCLTCS | PHHEDLVAIG | YKDGIVVIID | ISKKGEVIHR | LRGHDDEIHS | ||||
IAWCPLPGED | CLSINQEETS | EEAEITNGNA | VAQAPVTKGC | YLATGSKDQT | ||||
IRIWSCSRGR | GVMILKLPFL | KRRGGGIDPT | VKERLWLTLH | WPSNQPTQLV | ||||
SSCFGGELLQ | WDLTQSWRRK | YTLFSASSEG | QNHSRIVFNL | CPLQTEDDKQ | ||||
LLLSTSMDRD | VKCWDIATLE | CSWTLPSLGG | FAYSLAFSSV | DIGSLAIGVG | ||||
DGMIRVWNTL | SIKNNYDVKN | FWQGVKSKVT | ALCWHPTKEG | CLAFGTDDGK | ||||
VGLYDTYSNK | PPQISSTYHK | KTVYTLAWGP | PVPPMSLGGE | GDRPSLALYS | ||||
CGGEGIVLQH | NPWKLSGEAF | DINKLIRDTN | SIKYKLPVHT | EISWKADGKI | ||||
MALGNEDGSI | EIFQIPNLKL | ICTIQQHHKL | VNTISWHHEH | GSQPELSYLM | ||||
ASGSNNAVIY | VHNLKTVIES | SPESPVTITE | PYRTLSGHTA | KITSVAWSPH | ||||
HDGRLVSASY | DGTAQVWDAL | REEPLCNFRG | HRGRLLCVAW | SPLDPDCIYS | ||||
GADDFCVHKW | LTSMQDHSRP | PQGKKSIELE | KKRLSQPKAK | PKKKKKPTLR | ||||
TPVKLESIDG | NEEESMKENS | GPVENGVSDQ | EGEEQAREPE | LPCGLAPAVS | ||||
REPVICTPVS | SGFEKSKVTI | NNKVILLKKE | PPKEKPETLI | KKRKARSLLP | ||||
LSTSLDHRSK | EELHQDCLVL | ATAKHSRELN | EDVSADVEER | FHLGLFTDRA | ||||
TLYRMIDIEG | KGHLENGHPE | LFHQLMLWKG | DLKGVLQTAA | ERGELTDNLV | ||||
AMAPAAGYHV | WLWAVEAFAK | QLCFQDQYVK | AASHLLSIHK | VYEAVELLKS | ||||
NHFYREAIAI | AKARLRPEDP | VLKDLYLSWG | TVLERDGHYA | VAAKCYLGAT | ||||
CAYDAAKVLA | KKGDAASLRT | AAELAAIVGE | DELSASLALR | CAQELLLANN | ||||
WVGAQEALQL | HESLQGQRLV | FCLLELLSRH | LEEKQLSEGK | SSSSYHTWNT | ||||
GTEGPFVERV | TAVWKSIFSL | DTPEQYQEAF | QKLQNIKYPS | ATNNTPAKQL | ||||
LLHICHDLTL | AVLSQQMASW | DEAVQALLRA | VVRSYDSGSF | TIMQEVYSAF | ||||
LPDGCDHLRD | KLGDHQSPAT | PAFKSLEAFF | LYGRLYEFWW | SLSRPCPNSS | ||||
VWVRAGHRTL | SVEPSQQLDT | ASTEETDPET | SQPEPNRPSE | LDLRLTEEGE | ||||
RMLSTFKELF | SEKHASLQNS | QRTVAEVQET | LAEMIRQHQK | SQLCKSTANG | ||||
PDKNEPEVEA | EQPLCSSQSQ | CKEEKNEPLS | LPELTKRLTE | ANQRMAKFPE | ||||
SIKAWPFPDV | LECCLVLLLI | RSHFPGCLAQ | EMQQQAQELL | QKYGNTKTYR | ||||
RHCQTFCM |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, біосинтез білка, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
ред.- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lau C.K., Bachorik J.L., Dreyfuss G. (2009). Gemin5-snRNA interaction reveals an RNA binding function for WD repeat domains. Nat. Struct. Mol. Biol. 16: 486—491. PMID 19377484 DOI:10.1038/nsmb.1584
- Bradrick S.S., Gromeier M. (2009). Identification of gemin5 as a novel 7-methylguanosine cap-binding protein. PLoS ONE. 4: E7030—E7030. PMID 19750007 DOI:10.1371/journal.pone.0007030
- Yong J., Kasim M., Bachorik J.L., Wan L., Dreyfuss G. (2010). Gemin5 delivers snRNA precursors to the SMN complex for snRNP biogenesis. Mol. Cell. 38: 551—562. PMID 20513430 DOI:10.1016/j.molcel.2010.03.014
- Workman E., Kalda C., Patel A., Battle D.J. (2015). Gemin5 binds to the survival motor neuron mRNA to regulate SMN expression. J. Biol. Chem. 290: 15662—15669. PMID 25911097 DOI:10.1074/jbc.M115.646257
- Francisco-Velilla R., Fernandez-Chamorro J., Ramajo J., Martinez-Salas E. (2016). The RNA-binding protein Gemin5 binds directly to the ribosome and regulates global translation. Nucleic Acids Res. 44: 8335—8351. PMID 27507887 DOI:10.1093/nar/gkw702
Примітки
ред.- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20043 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8TEQ6 (англ.) . Архів оригіналу за 14 січня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |