GCFC2

GCFC2 (англ. GC-rich sequence DNA-binding factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 781 амінокислот, а молекулярна маса — 89 385.

GCFC2
Ідентифікатори
Символи	GCFC2, C2orf3, DNABF, GCF, TCF9, GC-rich sequence DNA-binding factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 189901 MGI: 2141656 HomoloGene: 2411 GeneCards: GCFC2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • ядерце • клітинне ядро • U2-type post-mRNA release spliceosomal complex • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • mRNA processing • spliceosomal complex assembly • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6936	330361
Ensembl	ENSG00000005436	ENSMUSG00000035125
UniProt	P16383	Q8BKT3
RefSeq (мРНК)	NM_001201334 NM_001201335 NM_003203	NM_177884
RefSeq (білок)	NP_001188263 NP_001188264 NP_003194	NP_808552
Локус (UCSC)	Хр. 2: 75.65 – 75.71 Mb	Хр. 6: 81.92 – 81.96 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAHRPKRTFR		QRAADSSDSD		GAEESPAEPG		APRELPVPGS		AEEEPPSGGG
RAQVAGLPHR		VRGPRGRGRV		WASSRRATKA		APRADEGSES		RTLDVSTDEE
DKIHHSSESK		DDQGLSSDSS		SSLGEKELSS		TVKIPDAAFI		QAARRKRELA
RAQDDYISLD		VQHTSSISGM		KRESEDDPES		EPDDHEKRIP		FTLRPQTLRQ
RMAEESISRN		EETSEESQED		EKQDTWEQQQ		MRKAVKIIEE		RDIDLSCGNG
SSKVKKFDTS		ISFPPVNLEI		IKKQLNTRLT		LLQETHRSHL		REYEKYVQDV
KSSKSTIQNL		ESSSNQALNC		KFYKSMKIYV		ENLIDCLNEK		IINIQEIESS
MHALLLKQAM		TFMKRRQDEL		KHESTYLQQL		SRKDETSTSG		NFSVDEKTQW
ILEEIESRRT		KRRQARVLSG		NCNHQEGTSS		DDELPSAEMI		DFQKSQGDIL
QKQKKVFEEV		QDDFCNIQNI		LLKFQQWREK		FPDSYYEAFI		SLCIPKLLNP
LIRVQLIDWN		PLKLESTGLK		EMPWFKSVEE		FMDSSVEDSK		KESSSDKKVL
SAIINKTIIP		RLTDFVEFLW		DPLSTSQTTS		LITHCRVILE		EHSTCENEVS
KSRQDLLKSI		VSRMKKAVED		DVFIPLYPKS		AVENKTSPHS		KFQERQFWSG
LKLFRNILLW		NGLLTDDTLQ		ELGLGKLLNR		YLIIALLNAT		PGPDVVKKCN
QVAACLPEKW		FENSAMRTSI		PQLENFIQFL		LQSAHKLSRS		EFRDEVEEII
LILVKIKALN		QAESFIGEHH		LDHLKSLIKE		D

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Kageyama R., Pastan I. (1989). Molecular cloning and characterization of a human DNA binding factor that represses transcription. Cell. 59: 815—825. PMID 2556218 DOI:10.1016/0092-8674(89)90605-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yoshimoto R., Okawa K., Yoshida M., Ohno M., Kataoka N. (2014). Identification of a novel component C2ORF3 in the lariat-intron complex: lack of C2ORF3 interferes with pre-mRNA splicing via intron turnover pathway. Genes Cells. 19: 78—87. PMID 24304693 DOI:10.1111/gtc.12114

Див. також

• Хромосома 2