GBP6

GBP6 (англ. Guanylate binding protein family member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 633 амінокислот, а молекулярна маса — 72 427.

GBP6
Ідентифікатори
Символи	GBP6, guanylate binding protein family member 6
Зовнішні ІД	OMIM: 612467 MGI: 97072 HomoloGene: 128731 GeneCards: GBP6
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • екзосома • symbiont-containing vacuole membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • defense response to bacterium • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • cellular response to interferon-gamma • defense response to protozoan • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	163351	17472
Ensembl	ENSG00000183347	ENSMUSG00000079363
UniProt	Q6ZN66	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_198460 NM_001320257	NM_001256005 NM_008620 NM_001359079 NM_001359080 NM_001359081 NM_001359082
RefSeq (білок)	NP_001307186 NP_940862	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 89.36 – 89.39 Mb	Хр. 5: 105.26 – 105.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MESGPKMLAP		VCLVENNNEQ		LLVNQQAIQI		LEKISQPVVV		VAIVGLYRTG
KSYLMNHLAG		QNHGFPLGST		VQSETKGIWM		WCVPHPSKPN		HTLVLLDTEG
LGDVEKGDPK		NDSWIFALAV		LLCSTFVYNS		MSTINHQALE		QLHYVTELTE
LIKAKSSPRP		DGVEDSTEFV		SFFPDFLWTV		RDFTLELKLN		GHPITEDEYL
ENALKLIQGN		NPRVQTSNFP		RECIRRFFPK		RKCFVFDRPT		NDKDLLANIE
KVSEKQLDPK		FQEQTNIFCS		YIFTHARTKT		LREGITVTGN		RLGTLAVTYV
EAINSGAVPC		LENAVITLAQ		RENSAAVQRA		ADYYSQQMAQ		RVKLPTDTLQ
ELLDMHAACE		REAIAIFMEH		SFKDENQEFQ		KKFMETTMNK		KGDFLLQNEE
SSVQYCQAKL		NELSKGLMES		ISAGSFSVPG		GHKLYMETKE		RIEQDYWQVP
RKGVKAKEVF		QRFLESQMVI		EESILQSDKA		LTDREKAVAV		DRAKKEAAEK
EQELLKQKLQ		EQQQQMEAQD		KSRKENIAQL		KEKLQMEREH		LLREQIMMLE
HTQKVQNDWL		HEGFKKKYEE		MNAEISQFKR		MIDTTKNDDT		PWIARTLDNL
ADELTAILSA		PAKLIGHGVK		GVSSLFKKHK		LPF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1