GBP3

GBP3 (англ. Guanylate binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 595 амінокислот, а молекулярна маса — 68 114.

GBP3
Ідентифікатори
Символи	GBP3, guanylate binding protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 600413 MGI: 95666 HomoloGene: 137233 GeneCards: GBP3
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • GO:0006184 GTPase activity • protein homodimerization activity Клітинна компонента • perinuclear region of cytoplasm • Golgi membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • defense response to virus • процес імунної системи • cellular response to interleukin-1 • cellular response to tumor necrosis factor • cellular response to interferon-gamma • обмін речовин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2635	14468
Ensembl	ENSG00000117226	ENSMUSG00000040264
UniProt	Q9H0R5	A4UUI2
RefSeq (мРНК)	NM_018284 NM_001319179 NM_001319180 NM_001319181	NM_010259
RefSeq (білок)	NP_001306108 NP_001306109 NP_001306110 NP_060754	NP_034389
Локус (UCSC)	Хр. 1: 89.01 – 89.02 Mb	Хр. 3: 142.3 – 142.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPEIHMTGP		MCLIENTNGE		LVANPEALKI		LSAITQPVVV		VAIVGLYRTG
KSYLMNKLAG		KNKGFSLGST		VKSHTKGIWM		WCVPHPKKPE		HTLVLLDTEG
LGDVKKGDNQ		NDSWIFTLAV		LLSSTLVYNS		MGTINQQAMD		QLYYVTELTH
RIRSKSSPDE		NENEDSADFV		SFFPDFVWTL		RDFSLDLEAD		GQPLTPDEYL
EYSLKLTQGT		SQKDKNFNLP		RLCIRKFFPK		KKCFVFDLPI		HRRKLAQLEK
LQDEELDPEF		VQQVADFCSY		IFSNSKTKTL		SGGIKVNGPR		LESLVLTYIN
AISRGDLPCM		ENAVLALAQI		ENSAAVQKAI		AHYDQQMGQK		VQLPAETLQE
LLDLHRVSER		EATEVYMKNS		FKDVDHLFQK		KLAAQLDKKR		DDFCKQNQEA
SSDRCSALLQ		VIFSPLEEEV		KAGIYSKPGG		YCLFIQKLQD		LEKKYYEEPR
KGIQAEEILQ		TYLKSKESVT		DAILQTDQIL		TEKEKEIEVE		CVKAESAQAS
AKMVEEMQIK		YQQMMEEKEK		SYQEHVKQLT		EKMERERAQL		LEEQEKTLTS
KLQEQARVLK		ERCQGESTQL		QNEIQKLQKT		LKKKTKRYMS		HKLKI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, апараті гольджі.

Література

• Nordmann A., Wixler L., Boergeling Y., Wixler V., Ludwig S. (2012). A new splice variant of the human guanylate-binding protein 3 mediates anti-influenza activity through inhibition of viral transcription and replication. FASEB J. 26: 1290—1300. PMID 22106366 DOI:10.1096/fj.11-189886
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1