GATAD2A

GATAD2A
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2L2L
Ідентифікатори
Символи	GATAD2A, p66alpha, GATA zinc finger domain containing 2A
Зовнішні ІД	OMIM: 614997 MGI: 2384585 HomoloGene: 9766 GeneCards: GATAD2A
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • sequence-specific DNA binding; • protein-macromolecule adaptor activity; • zinc ion binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• NuRD complex; • nuclear speck; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• Метилювання ДНК; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	54815
	234366
	ENSG00000167491
	ENSMUSG00000036180
	Q86YP4
	Q8CHY6
	NM_001300946; NM_017660; NM_001359631
	NM_001113345; NM_001113346; NM_001286450; NM_145596
	NP_001287875; NP_060130; NP_001346560
	NP_001106817; NP_001273379; NP_663571
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GATAD2A (англ. GATA zinc finger domain containing 2A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 633 амінокислот, а молекулярна маса — 68 063^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTEEACRTRS	QKRALERDPT	EDDVESKKIK	MERGLLASDL	NTDGDMRVTP
EPGAGPTQGL	LRATEATAMA	MGRGEGLVGD	GPVDMRTSHS	DMKSERRPPS
PDVIVLSDNE	QPSSPRVNGL	TTVALKETST	EALMKSSPEE	RERMIKQLKE
ELRLEEAKLV	LLKKLRQSQI	QKEATAQKPT	GSVGSTVTTP	PPLVRGTQNI
PAGKPSLQTS	SARMPGSVIP	PPLVRGGQQA	SSKLGPQASS	QVVMPPLVRG
AQQIHSIRQH	SSTGPPPLLL	APRASVPSVQ	IQGQRIIQQG	LIRVANVPNT
SLLVNIPQPT	PASLKGTTAT	SAQANSTPTS	VASVVTSAES	PASRQAAAKL
ALRKQLEKTL	LEIPPPKPPA	PEMNFLPSAA	NNEFIYLVGL	EEVVQNLLET
QGRMSAATVL	SREPYMCAQC	KTDFTCRWRE	EKSGAIMCEN	CMTTNQKKAL
KVEHTSRLKA	AFVKALQQEQ	EIEQRLLQQG	TAPAQAKAEP	TAAPHPVLKQ
VIKPRRKLAF	RSGEARDWSN	GAVLQASSQL	SRGSATTPRG	VLHTFSPSPK
LQNSASATAL	VSRTGRHSER	TVSAGKGSAT	SNWKKTPLST	GGTLAFVSPS
LAVHKSSSAV	DRQREYLLDM	IPPRSIPQSA	TWK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. (2002). Two highly related p66 proteins comprise a new family of potent transcriptional repressors interacting with MBD2 and MBD3. J. Biol. Chem. 277: 40958—40966. PMID 12183469 DOI:10.1074/jbc.M207467200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Brackertz M., Gong Z., Leers J., Renkawitz R. (2006). p66alpha and p66beta of the Mi-2/NuRD complex mediate MBD2 and histone interaction. Nucleic Acids Res. 34: 397—406. PMID 16415179 DOI:10.1093/nar/gkj437
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29989 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, Q86YP4 (англ.) . Архів оригіналу за 5 травня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29989 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q86YP4 (англ.) . Архів оригіналу за 5 травня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]