GABPB1

GABPB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1AWC
Ідентифікатори
Символи	GABPB1, BABPB2, E4TF1, E4TF1-47, E4TF1-53, E4TF1B, GABPB, GABPB2, NRF2B1, NRF2B2, GABPB-1, GA binding protein transcription factor beta subunit 1, GA binding protein transcription factor subunit beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600610 MGI: 95611 HomoloGene: 7723 GeneCards: GABPB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • protein heterodimerization activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • Нуклеоплазма; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • mitochondrion organization; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	2553
	14391
	ENSG00000104064
	ENSMUSG00000027361
	Q06547
	Q00420
NM_002041; NM_005254; NM_016654; NM_016655; NM_181427;
	NM_001320910; NM_001320915
NM_001271467; NM_001271468; NM_001271469; NM_001271470; NM_001271492;
	NM_010249; NM_207669; NM_001355108; NM_001355109
NP_001307839; NP_001307844; NP_002032; NP_005245; NP_057738;
	NP_057739; NP_852092; NP_057738.1
NP_001258396; NP_001258397; NP_001258398; NP_001258399; NP_001258421;
	NP_034379; NP_997552; NP_001342037; NP_001342038; NP_001393121; NP_001393122; NP_001393123; NP_001393124; NP_001393125; NP_001393126; NP_001393127; NP_001393128; NP_001393129; NP_001393130; NP_001393131; NP_001393132; NP_001393133; NP_001393134; NP_001393135; NP_001393136; NP_001393137; NP_001393138; NP_001393139; NP_001393140; NP_001393141; NP_001393142; NP_001393143; NP_001393144; NP_001393145; NP_001393146; NP_001393147; NP_001393148; NP_001393149; NP_001393150; NP_001393151; NP_001393152; NP_001393153; NP_001393154; NP_001393155; NP_001393156
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GABPB1 (англ. GA binding protein transcription factor beta subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 395 амінокислот, а молекулярна маса — 42 483^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLVDLGKKL	LEAARAGQDD	EVRILMANGA	PFTTDWLGTS	PLHLAAQYGH
YSTTEVLLRA	GVSRDARTKV	DRTPLHMAAS	EGHASIVEVL	LKHGADVNAK
DMLKMTALHW	ATEHNHQEVV	ELLIKYGADV	HTQSKFCKTA	FDISIDNGNE
DLAEILQIAM	QNQINTNPES	PDTVTIHAAT	PQFIIGPGGV	VNLTGLVSSE
NSSKATDETG	VSAVQFGNSS	TSVLATLAAL	AEASAPLSNS	SETPVVATEE
VVTAESVDGA	IQQVVSSGGQ	QVITIVTDGI	QLGNLHSIPT	SGIGQPIIVT
MPDGQQVLTV	PATDIAEETV	ISEEPPAKRQ	CIEIIENRVE	SAEIEEREAL
QKQLDEANRE	AQKYRQQLLK	KEQEAEAYRQ	KLEAMTRLQT	NKEAV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література ред.

Gugneja S., Virbasius J.V., Scarpulla R.C. (1995). Four structurally distinct, non-DNA-binding subunits of human nuclear respiratory factor 2 share a conserved transcriptional activation domain. Mol. Cell. Biol. 15: 102—111. PMID 7799916 DOI:10.1128/MCB.15.1.102
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Virbasius J.V., Virbasius C.A., Scarpulla R.C. (1993). Identity of GABP with NRF-2, a multisubunit activator of cytochrome oxidase expression, reveals a cellular role for an ETS domain activator of viral promoters. Genes Dev. 7: 380—392. PMID 8383622 DOI:10.1101/gad.7.3.380
Gugneja S., Virbasius C.M., Scarpulla R.C. (1996). Nuclear respiratory factors 1 and 2 utilize similar glutamine-containing clusters of hydrophobic residues to activate transcription. Mol. Cell. Biol. 16: 5708—5716. PMID 8816484 DOI:10.1128/MCB.16.10.5708
Vogel J.L., Kristie T.M. (2000). The novel coactivator C1 (HCF) coordinates multiprotein enhancer formation and mediates transcription activation by GABP. EMBO J. 19: 683—690. PMID 10675337 DOI:10.1093/emboj/19.4.683

Примітки ред.

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4074 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q06547 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також ред.

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4074 (англ.) . Архів оригіналу за 23 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q06547 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]