FARP1

FARP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4H6Y
Ідентифікатори
Символи	FARP1, CDEP, FARP1-IT1, PLEKHC2, PPP1R75, FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602654 MGI: 2446173 HomoloGene: 38098 GeneCards: FARP1
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння, fatty liver disease
Онтологія гена
Молекулярна функція	• guanyl-nucleotide exchange factor activity; • cytoskeletal protein binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • cell projection; • мембрана; • Філоподія; • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane; • клітинна мембрана; • dendritic spine; • синапс; • міжклітинні контакти; • дендрит (нейробіологія); • neuron projection; • цитоскелет; • цитоплазма;
Біологічний процес	• dendrite morphogenesis; • negative regulation of phosphatase activity; • multicellular organism development; • synapse assembly; • regulation of Rho protein signal transduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10160
	223254
	ENSG00000152767
	ENSMUSG00000025555
	Q9Y4F1
	F8VPU2
	NM_001001715; NM_001286839; NM_005766
	NM_134082
	NP_001001715; NP_001273768; NP_005757
	NP_598843
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

FARP1 (англ. FERM, ARH/RhoGEF and pleckstrin domain protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 045 амінокислот, а молекулярна маса — 118 633^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGEIEQRPTP	GSRLGAPENS	GISTLERGQK	PPPTPSGKLV	SIKIQMLDDT
QEAFEVPQRA	PGKVLLDAVC	NHLNLVEGDY	FGLEFPDHKK	ITVWLDLLKP
IVKQIRRPKH	VVVKFVVKFF	PPDHTQLQEE	LTRYLFALQV	KQDLAQGRLT
CNDTSAALLI	SHIVQSEIGD	FDEALDREHL	AKNKYIPQQD	ALEDKIVEFH
HNHIGQTPAE	SDFQLLEIAR	RLEMYGIRLH	PAKDREGTKI	NLAVANTGIL
VFQGFTKINA	FNWAKVRKLS	FKRKRFLIKL	RPDANSAYQD	TLEFLMASRD
FCKSFWKICV	EHHAFFRLFE	EPKPKPKPVL	FSRGSSFRFS	GRTQKQVLDY
VKEGGHKKVQ	FERKHSKIHS	IRSLASQPTE	LNSEVLEQSQ	QSTSLTFGEG
AESPGGQSCR	RGKEPKVSAG	EPGSHPSPAP	RRSPAGNKQA	DGAASAPTEE
EEEVVKDRTQ	QSKPQPPQPS	TGSLTGSPHL	SELSVNSQGG	VAPANVTLSP
NLSPDTKQAS	PLISPLLNDQ	ACPRTDDEDE	GRRKRFPTDK	AYFIAKEVST
TERTYLKDLE	VITSWFQSTV	SKEDAMPEAL	KSLIFPNFEP	LHKFHTNFLK
EIEQRLALWE	GRSNAQIRDY	QRIGDVMLKN	IQGMKHLAAH	LWKHSEALEA
LENGIKSSRR	LENFCRDFEL	QKVCYLPLNT	FLLRPLHRLM	HYKQVLERLC
KHHPPSHADF	RDCRAALAEI	TEMVAQLHGT	MIKMENFQKL	HELKKDLIGI
DNLVVPGREF	IRLGSLSKLS	GKGLQQRMFF	LFNDVLLYTS	RGLTASNQFK
VHGQLPLYGM	TIEESEDEWG	VPHCLTLRGQ	RQSIIVAASS	RSEMEKWVED
IQMAIDLAEK	SSSPAPEFLA	SSPPDNKSPD	EATAADQESE	DDLSASRTSL
ERQAPHRGNT	MVHVCWHRNT	SVSMVDFSIA	VENQLSGNLL	RKFKNSNGWQ
KLWVVFTNFC	LFFYKSHQDN	HPLASLPLLG	YSLTIPSESE	NIQKDYVFKL
HFKSHVYYFR	AESEYTFERW	MEVIRSATSS	ASRPHVLSHK	ESLVY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах, синаптосомах^[en].

Література ред.

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
He X., Kuo Y.C., Rosche T.J., Zhang X. (2013). Structural basis for autoinhibition of the guanine nucleotide exchange factor FARP2. Structure. 21: 355—364. PMID 23375260 DOI:10.1016/j.str.2013.01.001