FAM208A

FAM208A (англ. Family with sequence similarity 208 member A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 670 амінокислот, а молекулярна маса — 189 032.

FAM208A
Ідентифікатори
Символи	TASOR, C3orf63, RAP140, se89-1, family with sequence similarity 208 member A, transcription activation suppressor, FAM208A, TASOR1
Зовнішні ІД	OMIM: 616493 MGI: 1921694 HomoloGene: 9062 GeneCards: TASOR
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding Клітинна компонента • клітинне ядро • хромосома • нуклеоплазма • GO:0035328 Гетерохроматин Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of gene expression, epigenetic • positive regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • protein localization to heterochromatin • negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23272	218850
Ensembl	ENSG00000163946	ENSMUSG00000040651
UniProt	Q9UK61	Q69ZR9
RefSeq (мРНК)	NM_001112736 NM_015224 NM_001363940 NM_001365635 NM_001365636 NM_001365637 NM_001365638	NM_001114879 NM_028945
RefSeq (білок)	NP_001106207 NP_056039 NP_001350869 NP_001352564 NP_001352565 NP_001352566 NP_001352567	NP_001108351 NP_083221 NP_001391859
Локус (UCSC)	Хр. 3: 56.62 – 56.68 Mb	Хр. 14: 27.15 – 27.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATAVETEAC		QPTDASWESG		GGGDDEMKQA		LPELESSQQN		GGGGGLNIAE
PSGGAGREEN		AGAEAAQSLS		HEQPQDSSEA		GAAALPRGPE		EPERPVRRSF
QIPRKSREKK		ALFQPLTPGS		REFEDVVNIL		HSSYLEPTSV		TNFNYRRACL
VHNELLEKEF		TEKRRELKFD		GRLDKELSES		YAFLMVDRYQ		VQTICEKGLH
VGQSKITILG		SPSMGVYLSR		YADLLQANPL		DTGAMGDVVI		FKIMKGKIKS
IYDPMGVKSL		ESMLNKSALD		PTPKHECHVS		KNANRITSLL		AYRAYELTQY
YFYEYGFDEL		RRRPRHVCPY		AVVSFTYKDD		IQTPKFVPSS		RSNSFNTDRN
IDKYNYTLWK		GQLLNKGKLL		CYISLRSATR		AFLPIKLPEK		LDVETVMSID
HLKQKIPPAL		FYKETYLGPN		EVLKNGMYCS		LYEVVEKTRI		GSNMESLLQK
LDREKLVLVK		PLGDRGYLFL		LSPYQMVPPY		EYQTAKSRVL		HALFLFQEPR
SIVTSQKGST		NAAPQERHES		MPDVLKIAQF		LQFSLIQCRK		EFKNISAINF
HSVVEKYVSE		FFKRGFGSGK		REFIMFPYDS		RLDDKKFLYS		APRNKSHIDT
CLHAYIFRPE		VYQLPICKLK		ELFEENRKLQ		QFSPLSDYEG		QEEEMNGTKM
KFGKRNNSRG		EAIISGKQRS		SHSLDYDKDR		VKELINLIQC		RKKSVGGDSD
TEDMRSKTVL		KRKLEDLPEN		MRKLAKTSNL		SENCHLYEES		PQPIGSLGHD
ADLRRQQQDT		CNSGIADIHR		LFNWLSETLA		NARHSDASLT		DTVNKALGLS
TDDAYEELRQ		KHEYELNSTP		DKKDYEQPTC		AKVENAQFKG		TQSLLLEVDA
TSKYSVAIST		SEVGTDHKLH		LKEDPNLISV		NNFEDCSLCP		SVPIEHGFRR
QQSKSNNVEE		TEIHWKLIPI		TGGNARSPED		QLGKHGEKQT		PGMKSPEEQL
VCVPPQEAFP		NDPRVINRQR		SSDYQFPSSP		FTDTLKGTTE		DDVLTGQVEE
QCVPAAEAEP		PAVSETTERT		VLGEYNLFSR		KIEEILKQKN		VSYVSTVSTP
IFSTQEKMKR		LSEFIYSKTS		KAGVQEFVDG		LHEKLNTIII		KASAKGGNLP
PVSPNDSGAK		IASNPLERHV		IPVSSSDFNN		KHLLEPLCSD		PLKDTNSDEQ
HSTSALTEVE		MNQPQHATEL		MVTSDHIVPG		DMAREPVEET		TKSPSDVNIS
AQPALSNFIS		QLEPEVFNSL		VKIMKDVQKN		TVKFYIHEEE		ESVLCKEIKE
YLIKLGNTEC		HPEQFLERRS		KLDKLLIIIQ		NEDIAGFIHK		IPGLVTLKKL
PCVSFAGVDS		LDDVKNHTYN		ELFVSGGFIV		SDESILNPEV		VTVENLKNFL
TFLEELSTPE		GKWQWKVHCK		FQKKLKELGR		LNAKALSLLT		LLNVYQKKHL
VEILSYHNCD		SQTRNAPELD		CLIRLQAQNI		QQRHIVFLTE		KNIKMLSSYT
DNGIVVATAE		DFMQNFKNLV		GYHNSITEEN		LPQLGANENL		ESQSALLEND
EKDEEDMSLD		SGDEISHIEV		CSNFHSEIWE		KETKGSRGTD		QKKNTQIELQ
SSPDVQNSLL		EDKTYLDSEE		RTSIDIVCSE		GENSNSTEQD		SYSNFQVYHS
QLNMSHQFSH		FNVLTHQTFL		GTPYALSSSQ		SQENENYFLS		AYTESLDRDK
SPPPLSWGKS		DSSRPYSQEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• Li Q., Wen H., Ao S. (2000). Identification and cloning of the cDNA of a Rb-associated protein RAP140a. Sci. China, Ser. C, Life Sci. 43: 637—647. PMID 18726359 DOI:10.1007/BF02882285
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 3