FAM193B

FAM193B (англ. Family with sequence similarity 193 member B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 902 амінокислот, а молекулярна маса — 96 543.

FAM193B
Ідентифікатори
Символи	FAM193B, IRIZIO, family with sequence similarity 193 member B
Зовнішні ІД	OMIM: 615813 MGI: 2385851 HomoloGene: 10399 GeneCards: FAM193B
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54540	212483
Ensembl	ENSG00000146067	ENSMUSG00000021495
UniProt	Q96PV7	Q3U2K0
RefSeq (мРНК)	NM_001190946 NM_019057 NM_001366498 NM_001366499 NM_001366500	NM_145382
RefSeq (білок)	NP_001177875 NP_001353427 NP_001353428 NP_001353429	NP_663357
Локус (UCSC)	Хр. 5: 177.52 – 177.55 Mb	Хр. 13: 55.69 – 55.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTRRRSRPSG		GAGRRERARA		AGPQKPQAPE		PPPPPSLEAG		AGAGPPEAPA
EPDHDGPRED		DEPNLVPGPQ		VPPASSQPVQ		TCCLLCHRER		KGWEEGPSQN
GLVLQGEKLP		PDFMPKLVKN		LLGEMPLWVC		QSCRKSMEED		ERQTGREHAV
AISLSHTSCK		SQSCGDDSHS		SSSSSSSSSS		SSSSSCPGNS		GDWDPSSFLS
AHKLSGLWNS		PHSSGAMPGS		SLGSPPTIPG		EAFPVSEHHQ		HSDLTAPPNS
PTGHHPQPAS		LIPSHPSSFG		SPPHPHLLPT		TPAAPFPAQA		SECPVAAATA
PHTPGPCQSS		HLPSTSMPLL		KMPPPFSGCS		HPCSGHCGGH		CSGPLLPPPS
SQPLPSTHRD		PGCKGHKFAH		SGLACQLPQP		CEADEGLGEE		EDSSSERSSC
TSSSTHQRDG		KFCDCCYCEF		FGHNAPPAAP		TSRNYTEIRE		KLRSRLTRRK
EELPMKGGTL		GGIPGEPAVD		HRDVDELLEF		INSTEPKVPN		SARAAKRARH
KLKKKEKEKA		QLAAEALKQA		NRVSGSREPR		PARERLLEWP		DRELDRVNSF
LSSRLQEIKN		TVKDSIRASF		SVCELSMDSN		GFSKEGAAEP		EPQSLPPSNL
SGSSEQQPDI		NLDLSPLTLG		SPQNHTLQAP		GEPAPPWAEM		RGPHPPWTEV
RGPPPGIVPE		NGLVRRLNTV		PNLSRVIWVK		TPKPGYPSSE		EPSSKEVPSC
KQELPEPVSS		GGKPQKGKRQ		GSQAKKSEAS		PAPRPPASLE		VPSAKGQVAG
PKQPGRVLEL		PKVGSCAEAG		EGSRGSRPGP		GWAGSPKTEK		EKGSSWRNWP
GEAKARPQEQ		ESVQPSGPAR		PQSLPQGKGR		SRRSRNKQEK		PASSLDDVFL
PKDMDGVEMD		ETDREVEYFK		RFCLDSAKQT		RQKVAVNWTN		FSLKKTTPST
AQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Picchione F., Pritchard C., Lagutina I., Janke L., Grosveld G.C. (2011). IRIZIO: a novel gene cooperating with PAX3-FOXO1 in alveolar rhabdomyosarcoma (ARMS). Carcinogenesis. 32: 452—461. PMID 21177767 DOI:10.1093/carcin/bgq273

Див. також

• Хромосома 5