FAM120B

FAM120B (англ. Family with sequence similarity 120B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 910 амінокислот, а молекулярна маса — 103 783.

FAM120B
Ідентифікатори
Символи	FAM120B, CCPG, KIAA1838, PGCC1, dJ894D12.1, family with sequence similarity 120B, SAN1
Зовнішні ІД	OMIM: 612266 MGI: 1914794 HomoloGene: 13033 GeneCards: FAM120B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • диференціація клітин • peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway • fat cell differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84498	67544
Ensembl	ENSG00000275333 ENSG00000112584	ENSMUSG00000014763
UniProt	Q96EK7	Q6RI63
RefSeq (мРНК)	NM_001286379 NM_001286380 NM_001286381 NM_032448	NM_024203 NM_001357822
RefSeq (білок)	NP_001273308 NP_001273309 NP_001273310 NP_115824	NP_077165 NP_001344751
Локус (UCSC)	Хр. 6: 170.29 – 170.41 Mb	Хр. 17: 15.62 – 15.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGVRGLQGFV		GSTCPHICTV		VNFKELAEHH		RSKYPGCTPT		IVVDAMCCLR
YWYTPESWIC		GGQWREYFSA		LRDFVKTFTA		AGIKLIFFFD		GMVEQDKRDE
WVKRRLKNNR		EISRIFHYIK		SHKEQPGRNM		FFIPSGLAVF		TRFALKTLGQ
ETLCSLQEAD		YEVASYGLQH		NCLGILGEDT		DYLIYDTCPY		FSISELCLES
LDTVMLCREK		LCESLGLCVA		DLPLLACLLG		NDIIPEGMFE		SFRYKCLSSY
TSVKENFDKK		GNIILAVSDH		ISKVLYLYQG		EKKLEEILPL		GPNKALFYKG
MASYLLPGQK		SPWFFQKPKG		VITLDKQVIS		TSSDAESREE		VPMCSDAESR
QEVPMCTGPE		SRREVPVYTD		SEPRQEVPMC		SDPEPRQEVP		TCTGPESRRE
VPMCSDPEPR		QEVPMCTGPE		ARQEVPMYTD		SEPRQEVPMY		TDSEPRQEVP
MYTGSEPRQE		VPMYTGPESR		QEVPMYTGPE		SRQEVLIRTD		PESRQEIMCT
GHESKQEVPI		CTDPISKQED		SMCTHAEINQ		KLPVATDFEF		KLEALMCTNP
EIKQEDPTNV		GPEVKQQVTM		VSDTEILKVA		RTHHVQAESY		LVYNIMSSGE
IECSNTLEDE		LDQALPSQAF		IYRPIRQRVY		SLLLEDCQDV		TSTCLAVKEW
FVYPGNPLRH		PDLVRPLQMT		IPGGTPSLKI		LWLNQEPEIQ		VRRLDTLLAC
FNLSSSREEL		QAVESPFQAL		CCLLIYLFVQ		VDTLCLEDLH		AFIAQALCLQ
GKSTSQLVNL		QPDYINPRAV		QLGSLLVRGL		TTLVLVNSAC		GFPWKTSDFM
PWNVFDGKLF		HQKYLQSEKG		YAVEVLLEQN		RSRLTKFHNL		KAVVCKACMK
ENRRITGRAH		WGSHHAGRWG		RQGSSYHRTG		SGYSRSSQGQ		PWRDQGPGSR
QYEHDQWRRY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг, метилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• Li D., Kang Q., Wang D.-M. (2007). Constitutive coactivator of peroxisome proliferator-activated receptor (PPARgamma), a novel coactivator of PPARgamma that promotes adipogenesis. Mol. Endocrinol. 21: 2320—2333. PMID 17595322 DOI:10.1210/me.2006-0520
• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Holden S., Raymond F.L. (2003). The human gene CXorf17 encodes a member of a novel family of putative transmembrane proteins: cDNA cloning and characterization of CXorf17 and its mouse ortholog orf34. Gene. 318: 149—161. PMID 14585507 DOI:10.1016/S0378-1119(03)00770-4

Див. також

• Хромосома 6