FAM109A

FAM109A (англ. Family with sequence similarity 109 member A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 249 амінокислот, а молекулярна маса — 27 215.

FAM109A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QIS
Ідентифікатори
Символи	PHETA1, IPIP27A, SES1, family with sequence similarity 109 member A, FAM109A, PH domain containing endocytic trafficking adaptor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 614239 MGI: 2442708 HomoloGene: 16966 GeneCards: PHETA1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity Клітинна компонента • recycling endosome • ендосома • trans-Golgi network • комплекс Ґольджі • early endosome • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • clathrin-coated vesicle • гіалоплазма Біологічний процес • retrograde transport, endosome to Golgi • receptor recycling • endosome organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	144717	231717
Ensembl	ENSG00000198324	ENSMUSG00000044134
UniProt	Q8N4B1	Q8BH49
RefSeq (мРНК)	NM_001177996 NM_001177997 NM_144671	NM_175474 NM_001359949 NM_001359950
RefSeq (білок)	NP_001171467 NP_001171468 NP_653272	NP_780683 NP_001346878 NP_001346879
Локус (UCSC)	Хр. 12: 111.36 – 111.37 Mb	Хр. 5: 121.99 – 121.99 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKLNERSLAF		YATCDAPVDN		AGFLYKKGGR		HAAYHRRWFV		LRGNMLFYFE
DAASREPVGV		IILEGCTVEL		VEAAEEFAFA		VRFAGTRART		YVLAAESQDA
MEGWVKALSR		ASFDYLRLVV		RELEQQLAAV		RGGGGMALPQ		PQPQSLPLPP
SLPSALAPVP		SLPSAPAPVP		ALPLPRRPSA		LPPKENGCAV		WSTEATFRPG
PEPPPPPPRR		RASAPHGPLD		MAPFARLHEC		YGQEIRALRG		QWLSSRVQP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Swan L.E., Tomasini L., Pirruccello M., Lunardi J., De Camilli P. (2010). Two closely related endocytic proteins that share a common OCRL-binding motif with APPL1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 107: 3511—3516. PMID 20133602 DOI:10.1073/pnas.0914658107
• Noakes C.J., Lee G., Lowe M. (2011). The PH domain proteins IPIP27A and B link OCRL1 to receptor recycling in the endocytic pathway. Mol. Biol. Cell. 22: 606—623. PMID 21233288 DOI:10.1091/mbc.E10-08-0730
• Pirruccello M., Swan L.E., Folta-Stogniew E., De Camilli P. (2011). Recognition of the F&H motif by the Lowe syndrome protein OCRL. Nat. Struct. Mol. Biol. 18: 789—795. PMID 21666675 DOI:10.1038/nsmb.2071

Див. також

• Хромосома 12