FAAP20

FAAP20 (англ. Fanconi anemia core complex associated protein 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 180 амінокислот, а молекулярна маса — 19 869.

FAAP20
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MUQ, 2MUR, 3WWQ
Ідентифікатори
Символи	FAAP20, FP7162, C1orf86, Fanconi anemia core complex associated protein 20, FA core complex associated protein 20
Зовнішні ІД	OMIM: 615183 MGI: 1914763 HomoloGene: 18793 GeneCards: FAAP20
Онтологія гена Молекулярна функція • polyubiquitin modification-dependent protein binding • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • ubiquitin binding • ubiquitin-dependent protein binding Клітинна компонента • міжклітинні контакти • Fanconi anaemia nuclear complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • хромосома • ядерні тільця Біологічний процес • translesion synthesis • interstrand cross-link repair • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0100026 Репарація ДНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	199990	67513
Ensembl	ENSG00000162585	ENSMUSG00000073684
UniProt	Q6NZ36	Q3UN58
RefSeq (мРНК)	NM_001146310 NM_001256945 NM_001256946 NM_001256947 NM_001282670 NM_001282671 NM_001282672 NM_001282673 NM_182533	NM_001190445 NM_001347262
RefSeq (білок)	NP_001139782 NP_001243874 NP_001243875 NP_001243876 NP_001269599 NP_001269600 NP_001269601 NP_001269602 NP_872339	NP_001177374 NP_001334191
Локус (UCSC)	Хр. 1: 2.18 – 2.21 Mb	Хр. 4: 155.33 – 155.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAARRPRLG		LSRRRPRPAG		GPSGGRPWFL		LGGDERERLW		AELLRTVSPE
LILDHEVPSL		PAFPGQEPRC		GPEPTEVFTV		GPKTFSWTPF		PPDLWGPGRS
YRLLHGAGGH		LESPARSLPQ		RPAPDPCRAP		RVEQQPSVEG		AAALRSCPMC
QKEFAPRLTQ		LDVDSHLAQC		LAESTEDVTW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kim H., Yang K., Dejsuphong D., D'Andrea A.D. (2012). Regulation of Rev1 by the Fanconi anemia core complex. Nat. Struct. Mol. Biol. 19: 164—170. PMID 22266823 DOI:10.1038/nsmb.2222

Див. також

• Хромосома 1