EXOSC3

EXOSC3 (англ. Exosome component 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 275 амінокислот, а молекулярна маса — 29 572.

EXOSC3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NN6
Ідентифікатори
Символи	EXOSC3, PCH1B, RRP40, Rrp40p, bA3J10.7, hRrp-40, p10, CGI-102, Exosome component 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606489 MGI: 1913612 HomoloGene: 6867 GeneCards: EXOSC3
Пов'язані генетичні захворювання
pontocerebellar hypoplasia type 1B, pontocerebellar hypoplasia type 1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • 3'-5'-exoribonuclease activity • exoribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • гіалоплазма • nuclear exosome (RNase complex) • cytoplasmic exosome (RNase complex) • клітинне ядро • цитоплазма • Екзосома • ядерце • нуклеоплазма Біологічний процес • nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process • exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • regulation of mRNA stability • polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing • DNA deamination • CUT catabolic process • nuclear polyadenylation-dependent rRNA catabolic process • positive regulation of isotype switching • Перемикання класу імуноглобулінів • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5' • U4 snRNA 3'-end processing • rRNA processing • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51010	66362
Ensembl	ENSG00000107371	ENSMUSG00000028322
UniProt	Q9NQT5	Q7TQK4
RefSeq (мРНК)	NM_016042 NM_001002269	NM_025513 NM_001362788
RefSeq (білок)	NP_001002269 NP_057126	NP_079789 NP_001349717
Локус (UCSC)	Хр. 9: 37.76 – 37.83 Mb	Хр. 4: 45.32 – 45.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEPASVAAE		SLAGSRARAA		RTVLGQVVLP		GEELLLPEQE		DAEGPGGAVE
RPLSLNARAC		SRVRVVCGPG		LRRCGDRLLV		TKCGRLRHKE		PGSGSGGGVY
WVDSQQKRYV		PVKGDHVIGI		VTAKSGDIFK		VDVGGSEPAS		LSYLSFEGAT
KRNRPNVQVG		DLIYGQFVVA		NKDMEPEMVC		IDSCGRANGM		GVIGQDGLLF
KVTLGLIRKL		LAPDCEIIQE		VGKLYPLEIV		FGMNGRIWVK		AKTIQQTLIL
ANILEACEHM		TSDQRKQIFS		RLAES

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• van Dijk E.L., Schilders G., Pruijn G.J. (2007). Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome, which is involved in various mRNA decay pathways. RNA. 13: 1027—1035. PMID 17545563 DOI:10.1261/rna.575107
• Chen G., Guo X., Lv F., Xu Y., Gao G. (2008). p72 DEAD box RNA helicase is required for optimal function of the zinc-finger antiviral protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 4352—4357. PMID 18334637 DOI:10.1073/pnas.0712276105
• Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037
• Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2007). Cell. 131: 188—189. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Див. також

• Хромосома 9