EXOSC3

білок-кодуючий ген Homo Sapiens

EXOSC3 (англ. Exosome component 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 275 амінокислот, а молекулярна маса — 29 572[6].

EXOSC3
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи EXOSC3, PCH1B, RRP40, Rrp40p, bA3J10.7, hRrp-40, p10, CGI-102, Exosome component 3
Зовнішні ІД OMIM: 606489 MGI: 1913612 HomoloGene: 6867 GeneCards: EXOSC3
Пов'язані генетичні захворювання
pontocerebellar hypoplasia type 1B, pontocerebellar hypoplasia type 1[1]
Реагує на сполуку
Viroporin 3a[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_016042
NM_001002269
NM_025513
NM_001362788
RefSeq (білок)
NP_001002269
NP_057126
NP_079789
NP_001349717
Локус (UCSC) Хр. 9: 37.76 – 37.83 Mb Хр. 4: 45.32 – 45.34 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей
Послідовність амінокислот
1020304050
MAEPASVAAESLAGSRARAARTVLGQVVLPGEELLLPEQEDAEGPGGAVE
RPLSLNARACSRVRVVCGPGLRRCGDRLLVTKCGRLRHKEPGSGSGGGVY
WVDSQQKRYVPVKGDHVIGIVTAKSGDIFKVDVGGSEPASLSYLSFEGAT
KRNRPNVQVGDLIYGQFVVANKDMEPEMVCIDSCGRANGMGVIGQDGLLF
KVTLGLIRKLLAPDCEIIQEVGKLYPLEIVFGMNGRIWVKAKTIQQTLIL
ANILEACEHMTSDQRKQIFSRLAES

Задіяний у таких біологічних процесах, як процесінг рРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

ред.
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
  • van Dijk E.L., Schilders G., Pruijn G.J. (2007). Human cell growth requires a functional cytoplasmic exosome, which is involved in various mRNA decay pathways. RNA. 13: 1027—1035. PMID 17545563 DOI:10.1261/rna.575107
  • Chen G., Guo X., Lv F., Xu Y., Gao G. (2008). p72 DEAD box RNA helicase is required for optimal function of the zinc-finger antiviral protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 4352—4357. PMID 18334637 DOI:10.1073/pnas.0712276105
  • Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037
  • Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2007). Cell. 131: 188—189. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Примітки

ред.

Див. також

ред.