EPHB2

EPHB2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1B4F, 1F0M, 2QBX, 3ZFM
Ідентифікатори
Символи	EPHB2, Ephb2, Cek5, Drt, ETECK, Erk, Hek5, Nuk, Prkm5, Qek5, Sek3, Tyro5, CAPB, EK5, EPHT3, PCBC, EPH receptor B2, DRT, ERK, BDPLT22
Зовнішні ІД	OMIM: 600997 MGI: 99611 HomoloGene: 37925 GeneCards: EPHB2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • transmembrane-ephrin receptor activity; • kinase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • protein tyrosine kinase activity; • signaling receptor binding; • ATP binding; • axon guidance receptor activity; • ephrin receptor activity; • amyloid-beta binding; • signaling receptor activity; • GO:0032403 protein-containing complex binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • гіалоплазма; • cell projection; • мембрана; • integral component of plasma membrane; • extracellular region; • аксон; • neuronal cell body; • дендрит (нейробіологія); • клітинне ядро; • клітинна мембрана; • neuron projection; • receptor complex; • postsynapse; • glutamatergic synapse; • integral component of postsynaptic membrane; • integral component of presynaptic membrane;
Біологічний процес	• positive regulation of synapse assembly; • roof of mouth development; • фосфорилювання; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • optic nerve morphogenesis; • ephrin receptor signaling pathway; • навчення; • commissural neuron axon guidance; • нейробіологія розвитку; • multicellular organism development; • regulation of axonogenesis; • dendritic spine development; • dendritic spine morphogenesis; • negative regulation of axonogenesis; • protein phosphorylation; • positive regulation of long-term neuronal synaptic plasticity; • regulation of body fluid levels; • inner ear morphogenesis; • Ангіогенез; • GO:0000767 cell morphogenesis; • animal organ morphogenesis; • regulation of neuronal synaptic plasticity; • urogenital system development; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • corpus callosum development; • central nervous system projection neuron axonogenesis; • axonal fasciculation; • camera-type eye morphogenesis; • retinal ganglion cell axon guidance; • axon guidance; • trans-synaptic signaling by trans-synaptic complex, modulating synaptic transmission; • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation; • learning or memory; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • positive regulation of synaptic plasticity; • negative regulation of Ras protein signal transduction; • regulation of synapse assembly; • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • postsynaptic membrane assembly; • neuron projection retraction; • positive regulation of long-term synaptic potentiation; • positive regulation of protein localization to plasma membrane; • negative regulation of NMDA glutamate receptor activity; • positive regulation of NMDA glutamate receptor activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	2048
	13844
	ENSG00000133216
	ENSMUSG00000028664
	P29323
	P54763
	NM_001309192; NM_001309193; NM_004442; NM_017449
	NM_001290753; NM_010142
	NP_001296121; NP_001296122; NP_004433; NP_059145
	NP_001277682; NP_034272
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EPHB2 (англ. EPH receptor B2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 055 амінокислот, а молекулярна маса — 117 493^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALRRLGAAL	LLLPLLAAVE	ETLMDSTTAT	AELGWMVHPP	SGWEEVSGYD
ENMNTIRTYQ	VCNVFESSQN	NWLRTKFIRR	RGAHRIHVEM	KFSVRDCSSI
PSVPGSCKET	FNLYYYEADF	DSATKTFPNW	MENPWVKVDT	IAADESFSQV
DLGGRVMKIN	TEVRSFGPVS	RSGFYLAFQD	YGGCMSLIAV	RVFYRKCPRI
IQNGAIFQET	LSGAESTSLV	AARGSCIANA	EEVDVPIKLY	CNGDGEWLVP
IGRCMCKAGF	EAVENGTVCR	GCPSGTFKAN	QGDEACTHCP	INSRTTSEGA
TNCVCRNGYY	RADLDPLDMP	CTTIPSAPQA	VISSVNETSL	MLEWTPPRDS
GGREDLVYNI	ICKSCGSGRG	ACTRCGDNVQ	YAPRQLGLTE	PRIYISDLLA
HTQYTFEIQA	VNGVTDQSPF	SPQFASVNIT	TNQAAPSAVS	IMHQVSRTVD
SITLSWSQPD	QPNGVILDYE	LQYYEKELSE	YNATAIKSPT	NTVTVQGLKA
GAIYVFQVRA	RTVAGYGRYS	GKMYFQTMTE	AEYQTSIQEK	LPLIIGSSAA
GLVFLIAVVV	IAIVCNRRGF	ERADSEYTDK	LQHYTSGHMT	PGMKIYIDPF
TYEDPNEAVR	EFAKEIDISC	VKIEQVIGAG	EFGEVCSGHL	KLPGKREIFV
AIKTLKSGYT	EKQRRDFLSE	ASIMGQFDHP	NVIHLEGVVT	KSTPVMIITE
FMENGSLDSF	LRQNDGQFTV	IQLVGMLRGI	AAGMKYLADM	NYVHRDLAAR
NILVNSNLVC	KVSDFGLSRF	LEDDTSDPTY	TSALGGKIPI	RWTAPEAIQY
RKFTSASDVW	SYGIVMWEVM	SYGERPYWDM	TNQDVINAIE	QDYRLPPPMD
CPSALHQLML	DCWQKDRNHR	PKFGQIVNTL	DKMIRNPNSL	KAMAPLSSGI
NLPLLDRTIP	DYTSFNTVDE	WLEAIKMGQY	KESFANAGFT	SFDVVSQMMM
EDILRVGVTL	AGHQKKILNS	IQVMRAQMNQ	IQSVEGQPLA	RRPRATGRTK
RCQPRDVTKK	TCNSNDGKKK	GMGKKKTDPG	RGREIQGIFF	KEDSHKESND
CSCGG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як нейрогенез, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

Tang X.X., Pleasure D.E., Brodeur G.M., Ikegaki N. (1998). A variant transcript encoding an isoform of the human protein tyrosine kinase EPHB2 is generated by alternative splicing and alternative use of polyadenylation signals. Oncogene. 17: 521—526. PMID 9696046 DOI:10.1038/sj.onc.1201960
Thanos C.D., Goodwill K.E., Bowie J.U. (1999). Oligomeric structure of the human EphB2 receptor SAM domain. Science. 283: 833—836. PMID 9933164 DOI:10.1126/science.283.5403.833
Chan J., Watt V.M. (1991). eek and erk, new members of the eph subclass of receptor protein-tyrosine kinases. Oncogene. 6: 1057—1061. PMID 1648701
Unified nomenclature for Eph family receptors and their ligands, the ephrins. Cell. 90: 403—404. 1997. PMID 9267020

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3393 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, P29323 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3393 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, P29323 (англ.) . Архів оригіналу за 10 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]