EPG5
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
EPG5 (англ. Ectopic P-granules autophagy protein 5 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 18-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 579 амінокислот, а молекулярна маса — 292 481[5].
EPG5 | |||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ідентифікатори | |||||||||||||||||
Символи | EPG5, HEEW1, KIAA1632, VICIS, hectopic P-granules autophagy protein 5 homolog (C. elegans), ectopic P-granules autophagy protein 5 homolog, ectopic P-granules 5 autophagy tethering factor | ||||||||||||||||
Зовнішні ІД | OMIM: 615068 MGI: 1918673 HomoloGene: 14575 GeneCards: EPG5 | ||||||||||||||||
Пов'язані генетичні захворювання | |||||||||||||||||
Vici syndrome[1] | |||||||||||||||||
| |||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||
Види | Людина | Миша | |||||||||||||||
Entrez |
|
|
|||||||||||||||
Ensembl |
|
|
|||||||||||||||
UniProt |
|
|
|||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||
RefSeq (білок) |
|
| |||||||||||||||
Локус (UCSC) | Хр. 18: 45.85 – 45.97 Mb | н/д | |||||||||||||||
PubMed search | [2] | [3] | |||||||||||||||
Вікідані | |||||||||||||||||
|
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MAEAVKPQRR | AKAKASRTKT | KEKKKYETPQ | REESSEVSLP | KTSREQEIPS | ||||
LACEFKGDHL | KVVTDSQLQD | DASGQNESEM | FDVPLTSLTI | SNEESLTCNT | ||||
EPPKEGGEAR | PCVGDSAVTP | KVHPGDNVGT | KVETPKNFTE | VEENMSVQGG | ||||
LSESAPQSNF | SYTQPAMENI | QVRETQNSKE | DKQGLVCSSE | VPQNVGLQSS | ||||
CPAKHGFQTP | RVKKLYPQLP | AEIAGEAPAL | VAVKPLLRSE | RLYPELPSQL | ||||
ELVPFTKEQL | KILEPGSWLE | NVESYLEEFD | SMAHQDRHEF | YELLLNYSRC | ||||
RKQLLLAEAE | LLTLTSDCQN | AKSRLWQFKE | EQMSVQGICA | DQVKVFSYHR | ||||
YQRVEMNENA | LVELKKLFDA | KSEHLHQTLA | LHSYTSVLSR | LQVESYIYAL | ||||
LSSSAVLRSS | AIHQQGRASK | QTESIPSDLC | QLKECISVLF | MFTRRVNEDT | ||||
QFHDDILLWL | QKLVSVLQRV | GCPGDHLFLL | NHILRCPAGV | SKWAVPFIQI | ||||
KVLHNPSGVF | HFMQSLALLM | SPVKNRAEFM | CHMKPSERKP | SSSGPGSGTW | ||||
TLVDEGGEED | EDPETSWILL | NEDDLVTILA | QFPFHELFQH | LLGFKAKGDY | ||||
LPETTRPQEM | MKIFAFANSL | VELLAVGLET | FNRARYRQFV | KRIGYMIRMT | ||||
LGYVSDHWAQ | YVSHNQGSGL | AQQPYSMEKL | QVEFDELFLR | AVLHVLKAKR | ||||
LGIWLFMSEM | PFGTLSVQML | WKLFYLMHQV | ESENLQQLSS | SLQPAQCKQQ | ||||
LQDPEHFTNF | EKCLSSMNSS | EEICLLTTFA | QMAQARRTNV | DEDFIKIIVL | ||||
EIYEVSYVTL | STRETFSKVG | RELLGTITAV | HPEIISVLLD | RVQETIDQVG | ||||
MVSLYLFKEL | PLYLWQPSAS | EIAVIRDWLL | NYNLTVVKNK | LACVILEGLN | ||||
WGFAKQATLH | LDQAVHAEVA | LMVLEAYQKY | LAQKPYAGIL | SESMKQVSYL | ||||
ASIVRYGETP | ETSFNQWAWN | LILRLKLHKN | DYGIQPNCPA | VPFSVTVPDM | ||||
TESPTFHPLL | KAVKAGMPIG | CYLALSMTAV | GHSIEKFCAE | GIPLLGILVQ | ||||
SRHLRTVVHV | LDKILPLFYP | CQYYLLKNEQ | FLSHLLLFLH | LDSGVPQGVT | ||||
QQVTHKVAQH | LTGASHGDNV | KLLNSMIQAH | ISVSTQPNEV | GPVAVLEFWV | ||||
QALISQHLWY | REQPILFLMD | HLCKAAFQLM | QEDCIQKLLY | QQHKNALGYH | ||||
CDRSLLSSLV | SWIVAGNITP | SFVEGLATPT | QVWFAWTVLN | MESIFEEDSQ | ||||
LRRVIEGELV | INSAFTPDQA | LKKAQTQLKL | PIVPSLQRLL | IYRWAHQALV | ||||
TPSDHPLLPL | IWQKFFLLYL | HRPGPQYGLP | IDGCIGRRFF | QSPAHINLLK | ||||
EMKRRLTEVA | DFHHAASKAL | RVPAEGSEGL | PESHSGTPGY | LTSPELHKEL | ||||
VRLFNVYILW | LEDENFQKGD | TYIPSLPKHY | DIHRLAKVMQ | NQQDLWMEYL | ||||
NMERIYHEFQ | ETVGLWTQAK | LESHSTPCSL | SVQLDFTDPL | LAKERVLSNL | ||||
RKHEAPQPPL | ALHPTKPPVP | VISSAVLLSQ | KDATQLVCTD | LNLLQQQART | ||||
AALRESQQVA | LDGELLDTMP | KQYVNREEQT | TLHLECRGSS | GKKCQGAAVV | ||||
TVQFEGMHKN | EAISQQLHVL | RKEVKQLQAE | AAKPPSLNIV | EAAVHAENLI | ||||
TALVNAYKLQ | PTPGIQKVGI | SLFFTIVDYV | SDETQRHPPT | RQFFTSCIEI | ||||
LGQVFISGIK | SECRKVLETI | LKNSRLCSLL | SPFFTPNAAP | AEFIQLYEQV | ||||
VKFLSEDNSD | MIFMLLTKFD | LKQWLSATKP | PLSDRTRLLE | SIHLALTAWG | ||||
LEPDEDILMP | FNLFCKHWTY | LLLYQFPDQY | SDILRLLMQS | SAEQLLSPEC | ||||
WKATLRALGC | CAPSCQQGAA | STEGAVLPSS | SDALLSDKQV | METIQWLSDF | ||||
FYKLRLSKMD | FKSFGLFSKW | SPYMADVKTF | LGYLVKRLID | LEMTCLAQDP | ||||
TASRKTVLKS | LHSVIIQLFK | PWILVLEDNE | SSQQRHYPWL | ESDTVVASSI | ||||
VQLFTDCIDS | LHESFKDKLL | PGDAGALWLH | LMHYCEACTA | PKMPEFILYA | ||||
FHSTYRKLPW | KDLHPDQMLM | EAFFKVERGS | PKSCFLFLGS | VLCEVNWVSV | ||||
LSDAWNSSPH | PETRSMIVCL | LFMMILLAKE | VQLVDQTDSP | LLSLLGQTSS | ||||
LSWHLVDIVS | YQSVLSYFSS | HYPPSIILAK | ESYAELIMKL | LKVSAGLSIP | ||||
TDSQKHLDAV | PKCQAFTHQM | VQFLSTLEQN | GKITLAVLEQ | EMSKLLDDII | ||||
VFNPPDMDSQ | TRHMALSSLF | MEVLMMMNNA | TIPTAEFLRG | SIRTWIGQKM | ||||
HGLVVLPLLT | AACQSLASVR | HMAETTEACI | TAYFKESPLN | QNSGWGPILV | ||||
SLQVPELTME | EFLQECLTLG | SYLTLYVYLL | QCLNSEQTLR | NEMKVLLILS | ||||
KWLEQVYPSS | VEEEAKLFLW | WHQVLQLSLI | QTEQNDSVLT | ESVIRILLLV | ||||
QSRQNLVAEE | RLSSGILGAI | GFGRKSPLSN | RFRVVARSMA | AFLSVQVPME | ||||
DQIRLRPGSE | LHLTPKAQQA | LNALESMASS | KQYVEYQDQI | LQATQFIRHP | ||||
GHCLQDGKSF | LALLVNCLYP | EVHYLDHIR |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг.
Література
ред.- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з EPG5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29331 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9HCE0 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.
Див. також
ред.Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |