ELL2

ELL2 (англ. Elongation factor for RNA polymerase II 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 640 амінокислот, а молекулярна маса — 72 324.

ELL2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E5N
Ідентифікатори
Символи	ELL2, elongation factor for RNA polymerase II 2, MRCCAT1
Зовнішні ІД	OMIM: 601874 MGI: 2183438 HomoloGene: 8094 GeneCards: ELL2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро • transcription elongation factor complex • нуклеоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription elongation from RNA polymerase II promoter • snRNA transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22936	192657
Ensembl	ENSG00000118985	ENSMUSG00000001542
UniProt	O00472	Q3UKU1
RefSeq (мРНК)	NM_012081	NM_138953
RefSeq (білок)	NP_036213	NP_620403
Локус (UCSC)	Хр. 5: 95.89 – 95.96 Mb	Хр. 13: 75.85 – 75.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAGGTGGLR		EEQRYGLSCG		RLGQDNITVL		HVKLTETAIR		ALETYQSHKN
LIPFRPSIQF		QGLHGLVKIP		KNDPLNEVHN		FNFYLSNVGK		DNPQGSFDCI
QQTFSSSGAS		QLNCLGFIQD		KITVCATNDS		YQMTRERMTQ		AEEESRNRST
KVIKPGGPYV		GKRVQIRKAP		QAVSDTVPER		KRSTPMNPAN		TIRKTHSSST
ISQRPYRDRV		IHLLALKAYK		KPELLARLQK		DGVNQKDKNS		LGAILQQVAN
LNSKDLSYTL		KDYVFKELQR		DWPGYSEIDR		RSLESVLSRK		LNPSQNAAGT
SRSESPVCSS		RDAVSSPQKR		LLDSEFIDPL		MNKKARISHL		TNRVPPTLNG
HLNPTSEKSA		AGLPLPPAAA		AIPTPPPLPS		TYLPISHPPQ		IVNSNSNSPS
TPEGRGTQDL		PVDSFSQNDS		IYEDQQDKYT		SRTSLETLPP		GSVLLKCPKP
MEENHSMSHK		KSKKKSKKHK		EKDQIKKHDI		ETIEEKEEDL		KREEEIAKLN
NSSPNSSGGV		KEDCTASMEP		SAIELPDYLI		KYIAIVSYEQ		RQNYKDDFNA
EYDEYRALHA		RMETVARRFI		KLDAQRKRLS		PGSKEYQNVH		EEVLQEYQKI
KQSSPNYHEE		KYRCEYLHNK		LAHIKRLIGE		FDQQQAESWS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Simone F., Luo R.T., Polak P.E., Kaberlein J.J., Thirman M.J. (2003). ELL-associated factor 2 (EAF2), a functional homolog of EAF1 with alternative ELL binding properties. Blood. 101: 2355—2362. PMID 12446457 DOI:10.1182/blood-2002-06-1664
• Liu M., Hsu J., Chan C., Li Z., Zhou Q. (2012). The ubiquitin ligase Siah1 controls ELL2 stability and formation of super elongation complexes to modulate gene transcription. Mol. Cell. 46: 325—334. PMID 22483617 DOI:10.1016/j.molcel.2012.03.007
• Luo Z., Lin C., Shilatifard A. (2012). The super elongation complex (SEC) family in transcriptional control. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 13: 543—547. PMID 22895430 DOI:10.1038/nrm3417

Див. також

• Хромосома 5