EGR1

EGR1 (англ. Early growth response 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 543 амінокислот, а молекулярна маса — 57 507.

EGR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4R2A, 4R2C, 4R2D, 4X9J
Ідентифікатори
Символи	EGR1, AT225, G0S30, KROX-24, NGFI-A, TIS8, ZIF-268, ZNF225, early growth response 1
Зовнішні ІД	OMIM: 128990 MGI: 95295 HomoloGene: 56394 GeneCards: EGR1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • зв'язування з іоном металу • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • nucleic acid binding • hemi-methylated DNA-binding • double-stranded methylated DNA binding • zinc ion binding • promoter-specific chromatin binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • regulation of apoptotic process • cellular response to organic substance • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • glomerular mesangial cell proliferation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • response to glucose • transcription by RNA polymerase II • BMP signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • response to insulin • interleukin-1-mediated signaling pathway • cellular response to mycophenolic acid • T cell differentiation • type I interferon signaling pathway • positive regulation of glomerular metanephric mesangial cell proliferation • cellular response to gamma radiation • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • skeletal muscle cell differentiation • cellular response to heparin • regulation of protein sumoylation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to interleukin-8 • response to hypoxia • response to ischemia • еструс • positive regulation of hormone biosynthetic process • regulation of progesterone biosynthetic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901313 positive regulation of gene expression • circadian regulation of gene expression • locomotor rhythm • ритмічний процес • circadian temperature homeostasis • positive regulation of neuron death • positive regulation of tau-protein kinase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1958	13653
Ensembl	ENSG00000120738	ENSMUSG00000038418
UniProt	P18146	P08046
RefSeq (мРНК)	NM_001964	NM_007913
RefSeq (білок)	NP_001955	NP_031939
Локус (UCSC)	Хр. 5: 138.47 – 138.47 Mb	Хр. 18: 34.99 – 35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAKAEMQL		MSPLQISDPF		GSFPHSPTMD		NYPKLEEMML		LSNGAPQFLG
AAGAPEGSGS		NSSSSSSGGG		GGGGGGSNSS		SSSSTFNPQA		DTGEQPYEHL
TAESFPDISL		NNEKVLVETS		YPSQTTRLPP		ITYTGRFSLE		PAPNSGNTLW
PEPLFSLVSG		LVSMTNPPAS		SSSAPSPAAS		SASASQSPPL		SCAVPSNDSS
PIYSAAPTFP		TPNTDIFPEP		QSQAFPGSAG		TALQYPPPAY		PAAKGGFQVP
MIPDYLFPQQ		QGDLGLGTPD		QKPFQGLESR		TQQPSLTPLS		TIKAFATQSG
SQDLKALNTS		YQSQLIKPSR		MRKYPNRPSK		TPPHERPYAC		PVESCDRRFS
RSDELTRHIR		IHTGQKPFQC		RICMRNFSRS		DHLTTHIRTH		TGEKPFACDI
CGRKFARSDE		RKRHTKIHLR		QKDKKADKSV		VASSATSSLS		SYPSPVATSY
PSPVTTSYPS		PATTSYPSPV		PTSFSSPGSS		TYPSPVHSGF		PSPSVATTYS
SVPPAFPAQV		SSFPSSAVTN		SFSASTGLSD		MTATFSPRTI		EIC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Suggs S.V., Katzowitz J.L., Tsai-Morris C.-H., Sukhatme V.P. (1990). cDNA sequence of the human cellular early growth response gene Egr-1. Nucleic Acids Res. 18: 4283—4283. PMID 2377485 DOI:10.1093/nar/18.14.4283
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cullen E.M., Brazil J.C., O'Connor C.M. (2010). Mature human neutrophils constitutively express the transcription factor EGR-1. Mol. Immunol. 47: 1701—1709. PMID 20363028 DOI:10.1016/j.molimm.2010.03.003
• Zandarashvili L., White M.A., Esadze A., Iwahara J. (2015). Structural impact of complete CpG methylation within target DNA on specific complex formation of the inducible transcription factor Egr-1. FEBS Lett. 589: 1748—1753. PMID 25999311 DOI:10.1016/j.febslet.2015.05.022

Див. також

• Хромосома 5