EFNB2

EFNB2 (англ. Ephrin B2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 333 амінокислот, а молекулярна маса — 36 923.

EFNB2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2HLE, 2I85, 2VSK, 2VSM, 2WO2, 3GXU, 4UF7
Ідентифікатори
Символи	EFNB2, EPLG5, HTKL, Htk-L, LERK5, ephrin B2
Зовнішні ІД	OMIM: 600527 MGI: 105097 HomoloGene: 3019 GeneCards: EFNB2
Онтологія гена Молекулярна функція • virus receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor binding • ephrin receptor binding • protein tyrosine kinase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • focal adhesion • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse • integral component of presynaptic membrane • integral component of postsynaptic density membrane Біологічний процес • диференціація клітин • blood vessel morphogenesis • negative regulation of keratinocyte proliferation • regulation of chemotaxis • cell-cell signaling • anatomical structure morphogenesis • T cell costimulation • lymph vessel development • нейробіологія розвитку • cell migration involved in sprouting angiogenesis • multicellular organism development • адгезія клітин • nephric duct morphogenesis • Ангіогенез • animal organ morphogenesis • viral entry into host cell • positive regulation of cardiac muscle cell differentiation • GO:0022415 viral process • venous blood vessel morphogenesis • positive regulation of aorta morphogenesis • positive regulation of cell population proliferation • ephrin receptor signaling pathway • axon guidance • negative regulation of neuron projection development • peptidyl-tyrosine phosphorylation • presynapse assembly • regulation of postsynaptic membrane neurotransmitter receptor levels • regulation of postsynaptic neurotransmitter receptor internalization • positive regulation of neuron death Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1948	13642
Ensembl	ENSG00000125266	ENSMUSG00000001300
UniProt	P52799	P52800
RefSeq (мРНК)	NM_004093 NM_001372056 NM_001372057 NM_001372058	NM_010111 NM_001368299
RefSeq (білок)	NP_004084 NP_001358985 NP_001358986 NP_001358987	NP_034241 NP_001355228
Локус (UCSC)	Хр. 13: 106.49 – 106.54 Mb	Хр. 8: 8.67 – 8.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVRRDSVWK		YCWGVLMVLC		RTAISKSIVL		EPIYWNSSNS		KFLPGQGLVL
YPQIGDKLDI		ICPKVDSKTV		GQYEYYKVYM		VDKDQADRCT		IKKENTPLLN
CAKPDQDIKF		TIKFQEFSPN		LWGLEFQKNK		DYYIISTSNG		SLEGLDNQEG
GVCQTRAMKI		LMKVGQDASS		AGSTRNKDPT		RRPELEAGTN		GRSSTTSPFV
KPNPGSSTDG		NSAGHSGNNI		LGSEVALFAG		IASGCIIFIV		IIITLVVLLL
KYRRRHRKHS		PQHTTTLSLS		TLATPKRSGN		NNGSEPSDII		IPLRTADSVF
CPHYEKVSGD		YGHPVYIVQE		MPPQSPANIY		YKV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, ангіогенез, диференціація клітин, нейрогенез. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fueller T., Korff T., Kilian A., Dandekar G., Augustin H.G. (2003). Forward EphB4 signaling in endothelial cells controls cellular repulsion and segregation from ephrinB2 positive cells. J. Cell Sci. 116: 2461—2470. PMID 12734395 DOI:10.1242/jcs.00426

Див. також

• Хромосома 13