EDC4

EDC4
Ідентифікатори
Символи	EDC4, GE1, Ge-1, HEDL5, HEDLS, RCD-8, RCD8, enhancer of mRNA decapping 4
Зовнішні ІД	OMIM: 606030 MGI: 2446249 HomoloGene: 40937 GeneCards: EDC4
Пов'язані генетичні захворювання
	метаболічні захворювання, ішемічна хвороба серця
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • P-body; • мембрана; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • cytoplasmic ribonucleoprotein granule;
Біологічний процес	• exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA; • deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA; • GO:0022610 життєдіяльність;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23644
	234699
	ENSG00000038358
	ENSMUSG00000036270
	Q6P2E9
	Q3UJB9
	NM_014329
	NM_001301100; NM_181594
	NP_055144
NP_001288029; NP_853625; NP_001390999; NP_001391000; NP_001391001;
	NP_001391002; NP_001391003
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EDC4 (англ. Enhancer of mRNA decapping 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 401 амінокислот, а молекулярна маса — 151 661^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASCASIDIE	DATQHLRDIL	KLDRPAGGPS	AESPRPSSAY	NGDLNGLLVP
DPLCSGDSTS	ANKTGLRTMP	PINLQEKQVI	CLSGDDSSTC	IGILAKEVEI
VASSDSSISS	KARGSNKVKI	QPVAKYDWEQ	KYYYGNLIAV	SNSFLAYAIR
AANNGSAMVR	VISVSTSERT	LLKGFTGSVA	DLAFAHLNSP	QLACLDEAGN
LFVWRLALVN	GKIQEEILVH	IRQPEGTPLN	HFRRIIWCPF	IPEESEDCCE
ESSPTVALLH	EDRAEVWDLD	MLRSSHSTWP	VDVSQIKQGF	IVVKGHSTCL
SEGALSPDGT	VLATASHDGY	VKFWQIYIEG	QDEPRCLHEW	KPHDGRPLSC
LLFCDNHKKQ	DPDVPFWRFL	ITGADQNREL	KMWCTVSWTC	LQTIRFSPDI
FSSVSVPPSL	KVCLDLSAEY	LILSDVQRKV	LYVMELLQNQ	EEGHACFSSI
SEFLLTHPVL	SFGIQVVSRC	RLRHTEVLPA	EEENDSLGAD	GTHGAGAMES
AAGVLIKLFC	VHTKALQDVQ	IRFQPQLNPD	VVAPLPTHTA	HEDFTFGESR
PELGSEGLGS	AAHGSQPDLR	RIVELPAPAD	FLSLSSETKP	KLMTPDAFMT
PSASLQQITA	SPSSSSSGSS	SSSSSSSSSL	TAVSAMSSTS	AVDPSLTRPP
EELTLSPKLQ	LDGSLTMSSS	GSLQASPRGL	LPGLLPAPAD	KLTPKGPGQV
PTATSALSLE	LQEVEPLGLP	QASPSRTRSP	DVISSASTAL	SQDIPEIASE
ALSRGFGSSA	PEGLEPDSMA	SAASALHLLS	PRPRPGPELG	PQLGLDGGPG
DGDRHNTPSL	LEAALTQEAS	TPDSQVWPTA	PDITRETCST	LAESPRNGLQ
EKHKSLAFHR	PPYHLLQQRD	SQDASAEQSD	HDDEVASLAS	ASGGFGTKVP
APRLPAKDWK	TKGSPRTSPK	LKRKSKKDDG	DAAMGSRLTE	HQVAEPPEDW
PALIWQQQRE	LAELRHSQEE	LLQRLCTQLE	GLQSTVTGHV	ERALETRHEQ
EQRRLERALA	EGQQRGGQLQ	EQLTQQLSQA	LSSAVAGRLE	RSIRDEIKKT
VPPCVSRSLE	PMAGQLSNSV	ATKLTAVEGS	MKENISKLLK	SKNLTDAIAR
AAADTLQGPM	QAAYREAFQS	VVLPAFEKSC	QAMFQQINDS	FRLGTQEYLQ
QLESHMKSRK	AREQEAREPV	LAQLRGLVST	LQSATEQMAA	TVAGSVRAEV
QHQLHVAVGS	LQESILAQVQ	RIVKGEVSVA	LKEQQAAVTS	SIMQAMRSAA
GTPVPSAHLD	CQAQQAHILQ	LLQQGHLNQA	FQQALTAADL	NLVLYVCETV
DPAQVFGQPP	CPLSQPVLLS	LIQQLASDLG	TRTDLKLSYL	EEAVMHLDHS
DPITRDHMGS	VMAQVRQKLF	QFLQAEPHNS	LGKAARRLSL	MLHGLVTPSL
P

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Bloch D.B., Rabkina D., Quertermous T., Bloch K.D. (1994). The immunoreactive region in a novel autoantigen contains a nuclear localization sequence. Clin. Immunol. Immunopathol. 72: 380—389. PMID 7520377 DOI:10.1006/clin.1994.1156
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Garcia-Lozano J.R., Gonzalez-Escribano M.F., Wichmann I., Nunez-Roldan A. (1997). Cytoplasmic detection of a novel protein containing a nuclear localization sequence by human autoantibodies. Clin. Exp. Immunol. 107: 501—506. PMID 9067524 DOI:10.1046/j.1365-2249.1997.d01-955.x
Fenger-Groen M., Fillman C., Norrild B., Lykke-Andersen J. (2005). Multiple processing body factors and the ARE binding protein TTP activate mRNA decapping. Mol. Cell. 20: 905—915. PMID 16364915 DOI:10.1016/j.molcel.2005.10.031
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r