DTX3L

DTX3L
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3PG6
Ідентифікатори
Символи	DTX3L, BBAP, deltex 3 like, E3 ubiquitin ligase, deltex E3 ubiquitin ligase 3L, RNF143
Зовнішні ІД	OMIM: 613143 MGI: 2656973 HomoloGene: 51375 GeneCards: DTX3L
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • transferase activity; • GO:0048551 enzyme inhibitor activity; • GO:0010577 enzyme activator activity; • enzyme binding; • GO:0031493 histone binding; • ubiquitin-like protein ligase binding; • STAT family protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • early endosome; • лізосома; • lysosomal membrane; • ендосома; • мембрана; • early endosome membrane; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• histone monoubiquitination; • double-strand break repair; • GO:0100026 Репарація ДНК; • Убіквітин-залежний протеоліз; • cellular response to DNA damage stimulus; • protein polyubiquitination; • positive regulation of defense response to virus by host; • endosome to lysosome transport; • positive regulation of protein binding; • histone H2A ubiquitination; • histone H2B ubiquitination; • positive regulation of chromatin binding; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity; • protein autoubiquitination; • protein K48-linked ubiquitination; • positive regulation of protein localization to nucleus; • positive regulation of NAD+ ADP-ribosyltransferase activity; • positive regulation of protein localization to early endosome; • positive regulation of receptor catabolic process; • positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining; • процес імунної системи; • protein transport; • вроджений імунітет; • defense response to virus; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • Сигнальний шлях Notch;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	151636
	209200
	ENSG00000163840
	ENSMUSG00000049502
	Q8TDB6
	Q3UIR3
	NM_138287
	NM_001013371
	NP_612144
	NP_001013389
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DTX3L (англ. Deltex E3 ubiquitin ligase 3L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 740 амінокислот, а молекулярна маса — 83 554^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASHLRPPSP	LLVRVYKSGP	RVRRKLESYF	QSSKSSGGGE	CTVSTQEHEA
PGTFRVEFSE	RAAKERVLKK	GEHQILVDEK	PVPIFLVPTE	NSIKKNTRPQ
ISSLTQSQAE	TPSGDMHQHE	GHIPNAVDSC	LQKIFLTVTA	DLNCNLFSKE
QRAYITTLCP	SIRKMEGHDG	IEKVCGDFQD	IERIHQFLSE	QFLESEQKQQ
FSPSMTERKP	LSQQERDSCI	SPSEPETKAE	QKSNYFEVPL	PYFEYFKYIC
PDKINSIEKR	FGVNIEIQES	SPNMVCLDFT	SSRSGDLEAA	RESFASEFQK
NTEPLKQECV	SLADSKQANK	FKQELNHQFT	KLLIKEKGGE	LTLLGTQDDI
SAAKQKISEA	FVKIPVKLFA	ANYMMNVIEV	DSAHYKLLET	ELLQEISEIE
KRYDICSKVS	EKGQKTCILF	ESKDRQVDLS	VHAYASFIDA	FQHASCQLMR
EVLLLKSLGK	ERKHLHQTKF	ADDFRKRHPN	VHFVLNQESM	TLTGLPNHLA
KAKQYVLKGG	GMSSLAGKKL	KEGHETPMDI	DSDDSKAASP	PLKGSVSSEA
SELDKKEKGI	CVICMDTISN	KKVLPKCKHE	FCAPCINKAM	SYKPICPTCQ
TSYGIQKGNQ	PEGSMVFTVS	RDSLPGYESF	GTIVITYSMK	AGIQTEEHPN
PGKRYPGIQR	TAYLPDNKEG	RKVLKLLYRA	FDQKLIFTVG	YSRVLGVSDV
ITWNDIHHKT	SRFGGPEMYG	YPDPSYLKRV	KEELKAKGIE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Obiero J., Walker J.R., Dhe-Paganon S. (2012). Fold of the conserved DTC domain in deltex proteins. Proteins. 80: 1495—1499. PMID 22411408 DOI:10.1002/prot.24054

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30323 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8TDB6 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30323 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q8TDB6 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]