DHX58

DHX58 (англ. DExH-box helicase 58) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 678 амінокислот, а молекулярна маса — 76 613.

DHX58
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RQA, 2W4R, 3EQT
Ідентифікатори
Символи	DHX58, D11LGP2, D11lgp2e, LGP2, RLR-3, DEXH-box helicase 58
Зовнішні ІД	OMIM: 608588 MGI: 1931560 HomoloGene: 69371 GeneCards: DHX58
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • RNA binding • double-stranded RNA binding • hydrolase activity • ATP binding Клітинна компонента • цитоплазма Біологічний процес • negative regulation of MDA-5 signaling pathway • regulation of innate immune response • процес імунної системи • response to virus • positive regulation of RIG-I signaling pathway • defense response to virus • negative regulation of innate immune response • negative regulation of type I interferon production • вроджений імунітет • GO:0022415 viral process • positive regulation of MDA-5 signaling pathway • positive regulation of type I interferon production • negative regulation of RIG-I signaling pathway • response to bacterium Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79132	80861
Ensembl	ENSG00000108771	ENSMUSG00000017830
UniProt	Q96C10	Q99J87
RefSeq (мРНК)	NM_024119	NM_030150
RefSeq (білок)	NP_077024	NP_084426
Локус (UCSC)	Хр. 17: 42.1 – 42.11 Mb	Хр. 11: 100.59 – 100.6 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MELRSYQWEV		IMPALEGKNI		IIWLPTGAGK		TRAAAYVAKR		HLETVDGAKV
VVLVNRVHLV		TQHGEEFRRM		LDGRWTVTTL		SGDMGPRAGF		GHLARCHDLL
ICTAELLQMA		LTSPEEEEHV		ELTVFSLIVV		DECHHTHKDT		VYNVIMSQYL
ELKLQRAQPL		PQVLGLTASP		GTGGASKLDG		AINHVLQLCA		NLDTWCIMSP
QNCCPQLQEH		SQQPCKQYNL		CHRRSQDPFG		DLLKKLMDQI		HDHLEMPELS
RKFGTQMYEQ		QVVKLSEAAA		LAGLQEQRVY		ALHLRRYNDA		LLIHDTVRAV
DALAALQDFY		HREHVTKTQI		LCAERRLLAL		FDDRKNELAH		LATHGPENPK
LEMLEKILQR		QFSSSNSPRG		IIFTRTRQSA		HSLLLWLQQQ		QGLQTVDIRA
QLLIGAGNSS		QSTHMTQRDQ		QEVIQKFQDG		TLNLLVATSV		AEEGLDIPHC
NVVVRYGLLT		NEISMVQARG		RARADQSVYA		FVATEGSREL		KRELINEALE
TLMEQAVAAV		QKMDQAEYQA		KIRDLQQAAL		TKRAAQAAQR		ENQRQQFPVE
HVQLLCINCM		VAVGHGSDLR		KVEGTHHVNV		NPNFSNYYNV		SRDPVVINKV
FKDWKPGGVI		SCRNCGEVWG		LQMIYKSVKL		PVLKVRSMLL		ETPQGRIQAK
KWSRVPFSVP		DFDFLQHCAE		NLSDLSLD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, противірусний захист. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Komuro A., Horvath C.M. (2006). RNA- and virus-independent inhibition of antiviral signaling by RNA helicase LGP2. J. Virol. 80: 12332—12342. PMID 17020950 DOI:10.1128/JVI.01325-06
• Vitour D., Meurs E.F. (2007). Regulation of interferon production by RIG-I and LGP2: a lesson in self-control. Sci. STKE. 2007: PE20—PE20. PMID 17473309 DOI:10.1126/stke.3842007pe20
• Bamming D., Horvath C.M. (2009). Regulation of signal transduction by enzymatically inactive antiviral RNA helicase proteins MDA5, RIG-I, and LGP2. J. Biol. Chem. 284: 9700—9712. PMID 19211564 DOI:10.1074/jbc.M807365200
• Loo Y.M., Gale M. Jr. (2011). Immune signaling by RIG-I-like receptors. Immunity. 34: 680—692. PMID 21616437 DOI:10.1016/j.immuni.2011.05.003
• Broquet A.H., Hirata Y., McAllister C.S., Kagnoff M.F. (2011). RIG-I/MDA5/MAVS are required to signal a protective IFN response in rotavirus-infected intestinal epithelium. J. Immunol. 186: 1618—1626. PMID 21187438 DOI:10.4049/jimmunol.1002862

Див. також

• Хромосома 17