DEPDC1B

DEPDC1B (англ. DEP domain containing 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 529 амінокислот, а молекулярна маса — 61 771.

DEPDC1B
Ідентифікатори
Символи	DEPDC1B, BRCC3, XTP1, DEP domain containing 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 616073 MGI: 2145425 HomoloGene: 10157 GeneCards: DEPDC1B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of Wnt signaling pathway • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • cell migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55789	218581
Ensembl	ENSG00000035499	ENSMUSG00000021697
UniProt	Q8WUY9	Q8BH88
RefSeq (мРНК)	NM_001145208 NM_018369	NM_178683
RefSeq (білок)	NP_001138680 NP_060839	NP_848798
Локус (UCSC)	Хр. 5: 60.6 – 60.7 Mb	Хр. 13: 108.45 – 108.54 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEHRIVGPGP		YRATRLWNET		VELFRAKMPL		RKHRCRFKSY		EHCFTAAEAV
DWLHELLRCS		QNFGPEVTRK		QTVQLLKKFL		KNHVIEDIKG		KWGEEDFEDN
RHLYRFPPSS		PLKPYPKKPP		NQKDVIKFPE		WNDLPPGTSQ		ENIPVRPVVM
NSEMWYKRHS		IAIGEVPACR		LVHRRQLTEA		NVEEIWKSMT		LSYLQKILGL
DSLEEVLDVK		LVNSKFIIHN		VYSVSKQGVV		ILDDKSKELP		HWVLSAMKCL
ANWPNCSDLK		QPMYLGFEKD		VFKTIADYYG		HLKEPLLTFH		LFDAFVSVLG
LLQKEKVAVE		AFQICCLLLP		PENRRKLQLL		MRMMARICLN		KEMPPLCDGF
GTRTLMVQTF		SRCILCSKDE		VDLDELLAAR		LVTFLMDNYQ		EILKVPLALQ
TSIEERVAHL		RRVQIKYPGA		DMDITLSAPS		FCRQISPEEF		EYQRSYGSQE
PLAALLEEVI		TDAKLSNKEK		KKKLKQFQKS		YPEVYQERFP		TPESAALLFP
EKPKPKPQLL		MWALKKPFQP		FQRTRSFRM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5