DENND5B

DENND5B (англ. DENN domain containing 5B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 274 амінокислот, а молекулярна маса — 145 020.

DENND5B
Ідентифікатори
Символи	DENND5B, DENN domain containing 5B
Зовнішні ІД	OMIM: 617279 MGI: 2444273 HomoloGene: 44911 GeneCards: DENND5B
Онтологія гена Молекулярна функція • guanyl-nucleotide exchange factor activity • calcium channel activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • гіалоплазма Біологічний процес • detection of mechanical stimulus • calcium ion transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	160518	320560
Ensembl	ENSG00000170456	ENSMUSG00000030313
UniProt	Q6ZUT9	A2RSQ0
RefSeq (мРНК)	NM_001308339 NM_144973 NM_001366890 NM_001366891 NM_001366892 NM_001366893	NM_177192
RefSeq (білок)	NP_001295268 NP_659410 NP_001353819 NP_001353820 NP_001353821 NP_001353822	NP_796166
Локус (UCSC)	Хр. 12: 31.38 – 31.59 Mb	Хр. 6: 148.89 – 149 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGSCAAPGP		GSGSSPAACR		FAHYFVLCGI		DADSGLEPDE		LAGENFDQSP
LRRTFKSKVL		AHYPQNIEWN		PFDQDAVNML		CMPKGLSFRT		QTDNKDPQFH
SFIITREDGS		RTYGFVLTFY		EEVTSKQICT		AMQTLYQMHN		AEHYSSVYAS
SSCSMDSLAS		SLDEGDTTSL		LKLQRYNSYD		ISRDTLYVSK		SICLITPLPF
MQACKKFLIQ		LYKAVTSQQP		PPLPLESYIH		NILYEVPLPP		PGRSLKFYGV
YEPVICQRPG		PSELPLSDYP		LREAFELLGL		ENLVQVFTCV		LLEMQILLYS
QDYQRLMTVA		EGITTLLFPF		QWQHVYVPIL		PASLLHFLDA		PVPYLMGLQS
KEGTDRSKLE		LPQEANLCFV		DIDNHFIELP		EEFPQFPNKV		DFIQELSEVL
VQFGIPPEGS		LHCSESTSKL		KNMVLKDLVN		DKKNGNVCTN		NISMYELLKG
NETIARLQAL		AKRTGVAVEK		MDLSASLGEK		DKDLKLHCEE		AELRDYQLNV
QLREVFANRF		TQMFADYEAF		VIQTAQDMES		WLTNREQMQN		FDKASFLSDQ
PEPYLPFLSR		FIETQMFATF		IDNKIMSQWE		EKDPLLRVFD		TRIDKIRLYN
VRAPTLRTSI		YQKCSTLKEA		AQSIEQRLMK		MDHTAIHPHL		LDMKIGQGKY
EQGFFPKLQS		DVLATGPTSN		NRWVSRSATA		QRRKERLRQH		SEHVGLDNDL
REKYMQEARS		LGKNLRQPKL		SDLSPAVIAQ		TNCKFVEGLL		KECRMKTKRM
LVEKMGHEAV		ELGHGEANIT		GLEENTLIAS		LCDLLERIWS		HGLQVKQGKS
ALWSHLIQFQ		DREEKQEHLA		ESPVALGPER		RKSDSGVMLP		TLRVSLIQDM
RHIQNMSEIK		TDVGRARAWI		RLSLEKKLLS		QHLKQLLSNQ		PLTKKLYKRY
AFLRCEEERE		QFLYHLLSLN		AVDYFCFTSV		FTTIMIPYRS		VIIPIKKLSN
AIITSNPWIC		VSGELGDTGV		MQIPKNLLEM		TFECQNLGKL		TTVQIGHDNS
GLLAKWLVDC		VMVRNEITGH		TYRFPCGRWL		GKGIDDGSLE		RILIGELMTS
ASDEDLVKQC		RTPPQQKSPT		TARRLSITSL		TGKNNKPNAG		QIQEGIGEAV
NNIVKHFHKP		EKERGSLTVL		LCGENGLVAA		LEQVFHHGFK		SARIFHKNVF
IWDFIEKVVA		YFETTDQILD		NEDDVLIQKS		SCKTFCHYVN		AINTAPRNIG
KDGKFQILVC		LGTRDRLLPQ		WIPLLAECPA		ITRMYEESAL		LRDRMTVNSL
IRILQTIQDF		TIVLEGSLIK		GVDV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yoshimura S., Gerondopoulos A., Linford A., Rigden D.J., Barr F.A. (2010). Family-wide characterization of the DENN domain Rab GDP-GTP exchange factors. J. Cell Biol. 191: 367—381. PMID 20937701 DOI:10.1083/jcb.201008051

Див. також

• Хромосома 12