DEFA6

DEFA6 (англ. Defensin alpha 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 100 амінокислот, а молекулярна маса — 10 975.

DEFA6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ZMQ, 3QTE
Ідентифікатори
Символи	DEFA6, DEF6, HD-6, defensin alpha 6
Зовнішні ІД	OMIM: 600471 MGI: 3711900 HomoloGene: 130499 GeneCards: DEFA6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity Клітинна компонента • Golgi lumen • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • defense response • defense response to bacterium • defense response to fungus • antimicrobial humoral response • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • killing of cells of other organism • innate immune response in mucosa • antibacterial humoral response • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • membrane disruption in other organism • cellular response to lipopolysaccharide Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1671	100041688
Ensembl	ENSG00000164822 ENSG00000285136	ENSMUSG00000061845
UniProt	Q01524	E9QLQ1
RefSeq (мРНК)	NM_001926	NM_001177481
RefSeq (білок)	NP_001917	NP_001170952
Локус (UCSC)	Хр. 8: 6.92 – 6.93 Mb	Хр. 8: 21.56 – 21.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTLTILTAV		LLVALQAKAE		PLQAEDDPLQ		AKAYEADAQE		QRGANDQDFA
VSFAEDASSS		LRALGSTRAF		TCHCRRSCYS		TEYSYGTCTV		MGINHRFCCL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів. Секретований назовні.

Література

• Jones D.E., Bevins C.L. (1993). Defensin-6 mRNA in human Paneth cells: implications for antimicrobial peptides in host defense of the human bowel. FEBS Lett. 315: 187—192. PMID 8417977 DOI:10.1016/0014-5793(93)81160-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ericksen B., Wu Z., Lu W., Lehrer R.I. (2005). Antibacterial activity and specificity of the six human alpha-defensins. Antimicrob. Agents Chemother. 49: 269—275. PMID 15616305 DOI:10.1128/AAC.49.1.269-275.2005

Див. також

• Хромосома 8