DDX54

DDX54 (англ. DEAD-box helicase 54) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 881 амінокислот, а молекулярна маса — 98 595.

DDX54
Ідентифікатори
Символи	DDX54, DP97, DEAD-box helicase 54
Зовнішні ІД	OMIM: 611665 MGI: 1919240 HomoloGene: 5590 GeneCards: DDX54
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • nucleic acid binding • signaling receptor binding • estrogen receptor binding • hydrolase activity • ATP binding • RNA binding Клітинна компонента • мембрана • ядерце • клітинне ядро • комплекс Ґольджі • цитоплазма Біологічний процес • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • RNA secondary structure unwinding • RNA metabolic process • intracellular estrogen receptor signaling pathway • negative regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79039	71990
Ensembl	ENSG00000123064	ENSMUSG00000029599
UniProt	Q8TDD1	Q8K4L0
RefSeq (мРНК)	NM_024072 NM_001111322	NM_028041
RefSeq (білок)	NP_001104792 NP_076977	NP_082317
Локус (UCSC)	Хр. 12: 113.16 – 113.19 Mb	Хр. 5: 120.75 – 120.77 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAADKGPAAG		PRSRAAMAQW		RKKKGLRKRR		GAASQARGSD		SEDGEFEIQA
EDDARARKLG		PGRPLPTFPT		SECTSDVEPD		TREMVRAQNK		KKKKSGGFQS
MGLSYPVFKG		IMKKGYKVPT		PIQRKTIPVI		LDGKDVVAMA		RTGSGKTACF
LLPMFERLKT		HSAQTGARAL		ILSPTRELAL		QTLKFTKELG		KFTGLKTALI
LGGDRMEDQF		AALHENPDII		IATPGRLVHV		AVEMSLKLQS		VEYVVFDEAD
RLFEMGFAEQ		LQEIIARLPG		GHQTVLFSAT		LPKLLVEFAR		AGLTEPVLIR
LDVDTKLNEQ		LKTSFFLVRE		DTKAAVLLHL		LHNVVRPQDQ		TVVFVATKHH
AEYLTELLTT		QRVSCAHIYS		ALDPTARKIN		LAKFTLGKCS		TLIVTDLAAR
GLDIPLLDNV		INYSFPAKGK		LFLHRVGRVA		RAGRSGTAYS		LVAPDEIPYL
LDLHLFLGRS		LTLARPLKEP		SGVAGVDGML		GRVPQSVVDE		EDSGLQSTLE
ASLELRGLAR		VADNAQQQYV		RSRPAPSPES		IKRAKEMDLV		GLGLHPLFSS
RFEEEELQRL		RLVDSIKNYR		SRATIFEINA		SSRDLCSQVM		RAKRQKDRKA
IARFQQGQQG		RQEQQEGPVG		PAPSRPALQE		KQPEKEEEEE		AGESVEDIFS
EVVGRKRQRS		GPNRGAKRRR		EEARQRDQEF		YIPYRPKDFD		SERGLSISGE
GGAFEQQAAG		AVLDLMGDEA		QNLTRGRQQL		KWDRKKKRFV		GQSGQEDKKK
IKTESGRYIS		SSYKRDLYQK		WKQKQKIDDR		DSDEEGASDR		RGPERRGGKR
DRGQGASRPH		APGTPAGRVR		PELKTKQQIL		KQRRRAQKLH		FLQRGGLKQL
SARNRRRVQE		LQQGAFGRGA		RSKKGKMRKR		M

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12