DDX53

DDX53 (англ. DEAD-box helicase 53) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 631 амінокислот, а молекулярна маса — 71 154.

DDX53
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 3IUY
Ідентифікатори
Символи	DDX53, CAGE, CT26, DEAD-box helicase 53
Зовнішні ІД	HomoloGene: 85175 GeneCards: DDX53
Онтологія гена Молекулярна функція • ATP binding • hydrolase activity • nucleotide binding • nucleic acid binding • GO:0008026 helicase activity • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • RNA secondary structure unwinding Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	168400	н/д
Ensembl	ENSG00000184735	н/д
UniProt	Q86TM3	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_182699	н/д
RefSeq (білок)	NP_874358	н/д
Локус (UCSC)	Хр. X: 23 – 23 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSHWAPEWKR		AEANPRDLGA		SWDVRGSRGS		GWSGPFGHQG		PRAAGSREPP
LCFKIKNNMV		GVVIGYSGSK		IKDLQHSTNT		KIQIINGESE		AKVRIFGNRE
MKAKAKAAIE		TLIRKQESYN		SESSVDNAAS		QTPIGRNLGR		NDIVGEAEPL
SNWDRIRAAV		VECEKRKWAD		LPPVKKNFYI		ESKATSCMSE		MQVINWRKEN
FNITCDDLKS		GEKRLIPKPT		CRFKDAFQQY		PDLLKSIIRV		GIVKPTPIQS
QAWPIILQGI		DLIVVAQTGT		GKTLSYLMPG		FIHLDSQPIS		REQRNGPGML
VLTPTRELAL		HVEAECSKYS		YKGLKSICIY		GGRNRNGQIE		DISKGVDIII
ATPGRLNDLQ		MNNSVNLRSI		TYLVIDEADK		MLDMEFEPQI		RKILLDVRPD
RQTVMTSATW		PDTVRQLALS		YLKDPMIVYV		GNLNLVAVNT		VKQNIIVTTE
KEKRALTQEF		VENMSPNDKV		IMFVSQKHIA		DDLSSDFNIQ		GISAESLHGN
SEQSDQERAV		EDFKSGNIKI		LITTDIVSRG		LDLNDVTHVY		NYDFPRNIDV
YVHRVGYIGR		TGKTGTSVTL		ITQRDSKMAG		ELIKILDRAN		QSVPEDLVVM
AEQYKLNQQK		RHRETRSRKP		GQRRKEFYFL		S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома X