DDX4

DDX4 (англ. DEAD-box helicase 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 5-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 724 амінокислот, а молекулярна маса — 79 308.

DDX4
Ідентифікатори
Символи	DDX4, VASA, DEAD-box helicase 4
Зовнішні ІД	OMIM: 605281 MGI: 102670 HomoloGene: 49227 GeneCards: DDX4
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • hydrolase activity • ATP binding • ATPase activity Клітинна компонента • цитоплазма • piP-body • pi-body • P granule • perinuclear region of cytoplasm • ядерце Біологічний процес • flagellated sperm motility • диференціація клітин • male meiotic nuclear division • DNA methylation involved in gamete generation • multicellular organism development • GO:0007126 мейоз • RNA secondary structure unwinding • Сперматогенез • Сайленсинг генів • piRNA metabolic process • male meiosis I • negative regulation of transposition • piRNA biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54514	13206
Ensembl	ENSG00000152670	ENSMUSG00000021758
UniProt	Q9NQI0	Q61496
RefSeq (мРНК)	NM_001142549 NM_001166533 NM_001166534 NM_019039 NM_024415	NM_001145885 NM_010029
RefSeq (білок)	NP_001136021 NP_001160005 NP_001160006 NP_077726	NP_001139357 NP_034159
Локус (UCSC)	Хр. 5: 55.74 – 55.82 Mb	Хр. 13: 112.73 – 112.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDEDWEAEI		NPHMSSYVPI		FEKDRYSGEN		GDNFNRTPAS		SSEMDDGPSR
RDHFMKSGFA		SGRNFGNRDA		GECNKRDNTS		TMGGFGVGKS		FGNRGFSNSR
FEDGDSSGFW		RESSNDCEDN		PTRNRGFSKR		GGYRDGNNSE		ASGPYRRGGR
GSFRGCRGGF		GLGSPNNDLD		PDECMQRTGG		LFGSRRPVLS		GTGNGDTSQS
RSGSGSERGG		YKGLNEEVIT		GSGKNSWKSE		AEGGESSDTQ		GPKVTYIPPP
PPEDEDSIFA		HYQTGINFDK		YDTILVEVSG		HDAPPAILTF		EEANLCQTLN
NNIAKAGYTK		LTPVQKYSIP		IILAGRDLMA		CAQTGSGKTA		AFLLPILAHM
MHDGITASRF		KELQEPECII		VAPTRELVNQ		IYLEARKFSF		GTCVRAVVIY
GGTQLGHSIR		QIVQGCNILC		ATPGRLMDII		GKEKIGLKQI		KYLVLDEADR
MLDMGFGPEM		KKLISCPGMP		SKEQRQTLMF		SATFPEEIQR		LAAEFLKSNY
LFVAVGQVGG		ACRDVQQTVL		QVGQFSKREK		LVEILRNIGD		ERTMVFVETK
KKADFIATFL		CQEKISTTSI		HGDREQRERE		QALGDFRFGK		CPVLVATSVA
ARGLDIENVQ		HVINFDLPST		IDEYVHRIGR		TGRCGNTGRA		ISFFDLESDN
HLAQPLVKVL		TDAQQDVPAW		LEEIAFSTYI		PGFSGSTRGN		VFASVDTRKG
KSTLNTAGFS		SSQAPNPVDD		ESWD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, сперматогенез, РНК-залежне заглушення генів, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Castrillon D.H., Quade B.J., Wang T.Y., Quigley C., Crum C.P. (2000). The human VASA gene is specifically expressed in the germ cell lineage. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 9585—9590. PMID 10920202 DOI:10.1073/pnas.160274797
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Julaton V.T., Reijo Pera R.A. (2011). NANOS3 function in human germ cell development. Hum. Mol. Genet. 20: 2238—2250. PMID 21421998 DOI:10.1093/hmg/ddr114
• Li H.J., Yu N., Zhang X.Y., Jin W., Li H.Z. (2010). Spermatozoal protein profiles in male infertility with asthenozoospermia. Chin. Med. J. 123: 2879—2882. PMID 21034600

Див. також

• Хромосома 5