DDX39

DDX39 (англ. DExD-box helicase 39A) – білок, який кодується геном DDX39A, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 427 амінокислот, а молекулярна маса — 49 130.

DDX39
Ідентифікатори
Символи	DDX39A, BAT1, BAT1L, DDX39, DDXL, URH49, DEAD-box helicase 39A, DExD-box helicase 39A
Зовнішні ІД	MGI: 1915528 HomoloGene: 68487 GeneCards: DDX39A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0008026 helicase activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • hydrolase activity • ATP binding • ATPase activity • identical protein binding • RNA binding Клітинна компонента • мембрана • spliceosomal complex • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck • ядерце Біологічний процес • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • mRNA export from nucleus • cellular response to DNA damage stimulus • RNA secondary structure unwinding • регуляція експресії генів • RNA export from nucleus • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA 3'-end processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10212	68278
Ensembl	ENSG00000123136	ENSMUSG00000005481
UniProt	O00148	Q8VDW0
RefSeq (мРНК)	NM_001204057 NM_005804 NM_138998	NM_197982 NM_001363116 NM_001363117
RefSeq (білок)	NP_005795	NP_932099 NP_001350045 NP_001350046
Локус (UCSC)	Хр. 19: 14.41 – 14.42 Mb	Хр. 8: 84.44 – 84.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEQDVENDL		LDYDEEEEPQ		APQESTPAPP		KKDIKGSYVS		IHSSGFRDFL
LKPELLRAIV		DCGFEHPSEV		QHECIPQAIL		GMDVLCQAKS		GMGKTAVFVL
ATLQQIEPVN		GQVTVLVMCH		TRELAFQISK		EYERFSKYMP		SVKVSVFFGG
LSIKKDEEVL		KKNCPHVVVG		TPGRILALVR		NRSFSLKNVK		HFVLDECDKM
LEQLDMRRDV		QEIFRLTPHE		KQCMMFSATL		SKDIRPVCRK		FMQDPMEVFV
DDETKLTLHG		LQQYYVKLKD		SEKNRKLFDL		LDVLEFNQVI		IFVKSVQRCM
ALAQLLVEQN		FPAIAIHRGM		AQEERLSRYQ		QFKDFQRRIL		VATNLFGRGM
DIERVNIVFN		YDMPEDSDTY		LHRVARAGRF		GTKGLAITFV		SDENDAKILN
DVQDRFEVNV		AELPEEIDIS		TYIEQSR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Sugiura T., Nagano Y., Noguchi Y. (2007). DDX39, upregulated in lung squamous cell cancer, displays RNA helicase activities and promotes cancer cell growth. Cancer Biol. Ther. 6: 957—964. PMID 17548965 DOI:10.4161/cbt.6.6.4192
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lischka P., Toth Z., Thomas M., Mueller R., Stamminger T. (2006). The UL69 transactivator protein of human cytomegalovirus interacts with DEXD/H-Box RNA helicase UAP56 to promote cytoplasmic accumulation of unspliced RNA. Mol. Cell. Biol. 26: 1631—1643. PMID 16478985 DOI:10.1128/MCB.26.5.1631-1643.2006
• Sugiura T., Sakurai K., Nagano Y. (2007). Intracellular characterization of DDX39, a novel growth-associated RNA helicase. Exp. Cell Res. 313: 782—790. PMID 17196963 DOI:10.1016/j.yexcr.2006.11.014
• Wisskirchen C., Ludersdorfer T.H., Mueller D.A., Moritz E., Pavlovic J. (2011). Interferon-induced antiviral protein MxA interacts with the cellular RNA helicases UAP56 and URH49. J. Biol. Chem. 286: 34743—34751. PMID 21859714 DOI:10.1074/jbc.M111.251843

Див. також

• Хромосома 19