DDX19B

DDX19B (англ. DEAD-box helicase 19B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 479 амінокислот, а молекулярна маса — 53 927.

DDX19B
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 3EWS, 3FHC, 3FHT, 3FMO, 3FMP, 3G0H
Ідентифікатори
Символи	DDX19B, DBP5, DDX19, RNAh, DEAD-box helicase 19B
Зовнішні ІД	OMIM: 605812 MGI: 2148251 HomoloGene: 56032 GeneCards: DDX19B
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • nuclear envelope • Ядерна пора • Ядерна мембрана • екзосома • мембрана • клітинне ядро • catalytic step 2 spliceosome • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • protein transport • mRNA transport • RNA secondary structure unwinding • mRNA export from nucleus • Сплайсинг РНК • регуляція експресії генів • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11269	234733
Ensembl	ENSG00000157349	ENSMUSG00000033658
UniProt	Q9UMR2	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001014449 NM_001014451 NM_001257172 NM_001257173 NM_001257174 NM_001257175 NM_007242 NM_001363938	NM_001190786 NM_001190800 NM_172284
RefSeq (білок)	NP_001014449 NP_001014451 NP_001244101 NP_001244102 NP_001244103 NP_001244104 NP_009173 NP_001350867	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 16: 70.29 – 70.34 Mb	Хр. 8: 111.73 – 111.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATDSWALAV		DEQEAAAESL		SNLHLKEEKI		KPDTNGAVVK		TNANAEKTDE
EEKEDRAAQS		LLNKLIRSNL		VDNTNQVEVL		QRDPNSPLYS		VKSFEELRLK
PQLLQGVYAM		GFNRPSKIQE		NALPLMLAEP		PQNLIAQSQS		GTGKTAAFVL
AMLSQVEPAN		KYPQCLCLSP		TYELALQTGK		VIEQMGKFYP		ELKLAYAVRG
NKLERGQKIS		EQIVIGTPGT		VLDWCSKLKF		IDPKKIKVFV		LDEADVMIAT
QGHQDQSIRI		QRMLPRNCQM		LLFSATFEDS		VWKFAQKVVP		DPNVIKLKRE
EETLDTIKQY		YVLCSSRDEK		FQALCNLYGA		ITIAQAMIFC		HTRKTASWLA
AELSKEGHQV		ALLSGEMMVE		QRAAVIERFR		EGKEKVLVTT		NVCARGIDVE
QVSVVINFDL		PVDKDGNPDN		ETYLHRIGRT		GRFGKRGLAV		NMVDSKHSMN
ILNRIQEHFN		KKIERLDTDD		LDEIEKIAN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, комплексі ядерної пори.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• von Moeller H., Basquin C., Conti E. (2009). The mRNA export protein DBP5 binds RNA and the cytoplasmic nucleoporin NUP214 in a mutually exclusive manner. Nat. Struct. Mol. Biol. 16: 247—254. PMID 19219046 DOI:10.1038/nsmb.1561

Див. також

• Хромосома 16