DDR2 (ген)

DDR2 (англ. Discoidin domain receptor tyrosine kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 855 амінокислот, а молекулярна маса — 96 736.

DDR2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2WUH, 2Z4F
Ідентифікатори
Символи	DDR2, MIG20a, NTRKR3, TKT, TYRO10, discoidin domain receptor tyrosine kinase 2, WRCN
Зовнішні ІД	OMIM: 191311 MGI: 1345277 HomoloGene: 68505 GeneCards: DDR2
Пов'язані генетичні захворювання
spondyloepimetaphyseal dysplasia-short limb-abnormal calcification syndrome
Реагує на сполуку
сорафеніб
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • protein tyrosine kinase collagen receptor activity • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • collagen binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • focal adhesion • integral component of plasma membrane • екзосома • apical plasma membrane • клітинна мембрана • actin cytoskeleton • receptor complex Біологічний процес • collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway • осифікація • фосфорилювання • collagen fibril organization • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • regulation of bone mineralization • positive regulation of fibroblast proliferation • biomineral tissue development • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • extracellular matrix organization • regulation of extracellular matrix disassembly • positive regulation of extracellular matrix disassembly • protein phosphorylation • адгезія клітин • positive regulation of osteoblast differentiation • chondrocyte proliferation • positive regulation of cell population proliferation • peptidyl-tyrosine phosphorylation • endochondral bone growth • positive regulation of fibroblast migration • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of protein kinase activity • protein autophosphorylation • regulation of cell-matrix adhesion • cell-matrix adhesion • диференціація клітин • regulation of extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4921	18214
Ensembl	ENSG00000162733	ENSMUSG00000026674
UniProt	Q16832	Q62371
RefSeq (мРНК)	NM_001014796 NM_006182 NM_001354982 NM_001354983	NM_022563
RefSeq (білок)	NP_001014796 NP_006173 NP_001341911 NP_001341912	NP_072075
Локус (UCSC)	Хр. 1: 162.63 – 162.79 Mb	Хр. 1: 169.8 – 169.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MILIPRMLLV		LFLLLPILSS		AKAQVNPAIC		RYPLGMSGGQ		IPDEDITASS
QWSESTAAKY		GRLDSEEGDG		AWCPEIPVEP		DDLKEFLQID		LHTLHFITLV
GTQGRHAGGH		GIEFAPMYKI		NYSRDGTRWI		SWRNRHGKQV		LDGNSNPYDI
FLKDLEPPIV		ARFVRFIPVT		DHSMNVCMRV		ELYGCVWLDG		LVSYNAPAGQ
QFVLPGGSII		YLNDSVYDGA		VGYSMTEGLG		QLTDGVSGLD		DFTQTHEYHV
WPGYDYVGWR		NESATNGYIE		IMFEFDRIRN		FTTMKVHCNN		MFAKGVKIFK
EVQCYFRSEA		SEWEPNAISF		PLVLDDVNPS		ARFVTVPLHH		RMASAIKCQY
HFADTWMMFS		EITFQSDAAM		YNNSEALPTS		PMAPTTYDPM		LKVDDSNTRI
LIGCLVAIIF		ILLAIIVIIL		WRQFWQKMLE		KASRRMLDDE		MTVSLSLPSD
SSMFNNNRSS		SPSEQGSNST		YDRIFPLRPD		YQEPSRLIRK		LPEFAPGEEE
SGCSGVVKPV		QPSGPEGVPH		YAEADIVNLQ		GVTGGNTYSV		PAVTMDLLSG
KDVAVEEFPR		KLLTFKEKLG		EGQFGEVHLC		EVEGMEKFKD		KDFALDVSAN
QPVLVAVKML		RADANKNARN		DFLKEIKIMS		RLKDPNIIHL		LAVCITDDPL
CMITEYMENG		DLNQFLSRHE		PPNSSSSDVR		TVSYTNLKFM		ATQIASGMKY
LSSLNFVHRD		LATRNCLVGK		NYTIKIADFG		MSRNLYSGDY		YRIQGRAVLP
IRWMSWESIL		LGKFTTASDV		WAFGVTLWET		FTFCQEQPYS		QLSDEQVIEN
TGEFFRDQGR		QTYLPQPAIC		PDSVYKLMLS		CWRRDTKNRP		SFQEIHLLLL
QQGDE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як остеогенез, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Vogel W., Gish G.D., Alves F., Pawson T. (1997). The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen. Mol. Cell. 1: 13—23. PMID 9659899 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80003-9
• Wall S.J., Werner E., Werb Z., DeClerck Y.A. (2005). Discoidin domain receptor 2 mediates tumor cell cycle arrest induced by fibrillar collagen. J. Biol. Chem. 280: 40187—40194. PMID 16186104 DOI:10.1074/jbc.M508226200
• Vogel W.F., Abdulhussein R., Ford C.E. (2006). Sensing extracellular matrix: an update on discoidin domain receptor function. Cell. Signal. 18: 1108—1116. PMID 16626936 DOI:10.1016/j.cellsig.2006.02.012
• Leitinger B. (2011). Transmembrane collagen receptors. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 27: 265—290. PMID 21568710 DOI:10.1146/annurev-cellbio-092910-154013

Див. також

• Хромосома 1