DDB1
білок-кодуючий ген Homo Sapiens
DDB1 (англ. Damage specific DNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 140 амінокислот, а молекулярна маса — 126 968[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MSYNYVVTAQ | KPTAVNGCVT | GHFTSAEDLN | LLIAKNTRLE | IYVVTAEGLR | ||||
PVKEVGMYGK | IAVMELFRPK | GESKDLLFIL | TAKYNACILE | YKQSGESIDI | ||||
ITRAHGNVQD | RIGRPSETGI | IGIIDPECRM | IGLRLYDGLF | KVIPLDRDNK | ||||
ELKAFNIRLE | ELHVIDVKFL | YGCQAPTICF | VYQDPQGRHV | KTYEVSLREK | ||||
EFNKGPWKQE | NVEAEASMVI | AVPEPFGGAI | IIGQESITYH | NGDKYLAIAP | ||||
PIIKQSTIVC | HNRVDPNGSR | YLLGDMEGRL | FMLLLEKEEQ | MDGTVTLKDL | ||||
RVELLGETSI | AECLTYLDNG | VVFVGSRLGD | SQLVKLNVDS | NEQGSYVVAM | ||||
ETFTNLGPIV | DMCVVDLERQ | GQGQLVTCSG | AFKEGSLRII | RNGIGIHEHA | ||||
SIDLPGIKGL | WPLRSDPNRE | TDDTLVLSFV | GQTRVLMLNG | EEVEETELMG | ||||
FVDDQQTFFC | GNVAHQQLIQ | ITSASVRLVS | QEPKALVSEW | KEPQAKNISV | ||||
ASCNSSQVVV | AVGRALYYLQ | IHPQELRQIS | HTEMEHEVAC | LDITPLGDSN | ||||
GLSPLCAIGL | WTDISARILK | LPSFELLHKE | MLGGEIIPRS | ILMTTFESSH | ||||
YLLCALGDGA | LFYFGLNIET | GLLSDRKKVT | LGTQPTVLRT | FRSLSTTNVF | ||||
ACSDRPTVIY | SSNHKLVFSN | VNLKEVNYMC | PLNSDGYPDS | LALANNSTLT | ||||
IGTIDEIQKL | HIRTVPLYES | PRKICYQEVS | QCFGVLSSRI | EVQDTSGGTT | ||||
ALRPSASTQA | LSSSVSSSKL | FSSSTAPHET | SFGEEVEVHN | LLIIDQHTFE | ||||
VLHAHQFLQN | EYALSLVSCK | LGKDPNTYFI | VGTAMVYPEE | AEPKQGRIVV | ||||
FQYSDGKLQT | VAEKEVKGAV | YSMVEFNGKL | LASINSTVRL | YEWTTEKELR | ||||
TECNHYNNIM | ALYLKTKGDF | ILVGDLMRSV | LLLAYKPMEG | NFEEIARDFN | ||||
PNWMSAVEIL | DDDNFLGAEN | AFNLFVCQKD | SAATTDEERQ | HLQEVGLFHL | ||||
GEFVNVFCHG | SLVMQNLGET | STPTQGSVLF | GTVNGMIGLV | TSLSESWYNL | ||||
LLDMQNRLNK | VIKSVGKIEH | SFWRSFHTER | KTEPATGFID | GDLIESFLDI | ||||
SRPKMQEVVA | NLQYDDGSGM | KREATADDLI | KVVEELTRIH |
Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література ред.
- Hwang B.J., Liao J.C., Chu G. (1996). Isolation of a cDNA encoding a UV-damaged DNA binding factor defective in xeroderma pigmentosum group E cells. Mutat. Res. 362: 105—117. PMID 8538642 DOI:10.1016/0921-8777(95)00040-2
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hwang B.J., Toering S., Francke U., Chu G. (1998). p48 Activates a UV-damaged-DNA binding factor and is defective in xeroderma pigmentosum group E cells that lack binding activity. Mol. Cell. Biol. 18: 4391—4399. PMID 9632823 DOI:10.1128/MCB.18.7.4391
- Chen X., Zhang Y., Douglas L., Zhou P. (2001). UV-damaged DNA-binding proteins are targets of CUL-4A-mediated ubiquitination and degradation. J. Biol. Chem. 276: 48175—48182. PMID 11673459 DOI:10.1074/jbc.M106808200
- Lin-Marq N., Bontron S., Leupin O., Strubin M. (2001). Hepatitis B virus X protein interferes with cell viability through interaction with the p127-kDa UV-damaged DNA-binding protein. Virology. 287: 266—274. PMID 11531405 DOI:10.1006/viro.2001.1036
- Leupin O., Bontron S., Strubin M. (2003). Hepatitis B virus X protein and simian virus 5 V protein exhibit similar UV-DDB1 binding properties to mediate distinct activities. J. Virol. 77: 6274—6283. PMID 12743284 DOI:10.1128/JVI.77.11.6274-6283.2003
Примітки ред.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Damage specific DNA binding protein 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2717 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.
- ↑ UniProt, Q16531 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 28 лютого 2017.
Див. також ред.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |