DAPK1

DAPK1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IG1, 1JKK, 1JKL, 1JKS, 1JKT, 1P4F, 1WVX, 1WVY, 1YR5, 2W4J, 2W4K, 2X0G, 2XUU, 2XZS, 2Y0A, 2Y4P, 2Y4V, 2YAK, 3DFC, 3DGK, 3EH9, 3EHA, 3F5G, 3F5U, 3GU4, 3GU5, 3GU6, 3GU7, 3GU8, 3GUB, 3ZXT, 4B4L, 4PF4, 4TL0, 4TXC, 4UV0, 4YO4, 4YPD, 5AUW, 5AUU, 5AV1, 5AUY, 5AUT, 5AUX, 5AUV, 5AUZ, 5AV0, 5AV4, 5AV2, 5AV3
Ідентифікатори
Символи	DAPK1, DAPK, death associated protein kinase 1, ROCO3
Зовнішні ІД	OMIM: 600831 MGI: 1916885 HomoloGene: 3626 GeneCards: DAPK1
Пов'язані генетичні захворювання
	натуральна віспа, рак підшлункової залози
Реагує на сполуку
	staurosporine
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • GTP binding; • syntaxin-1 binding; • kinase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • calmodulin-dependent protein kinase activity; • protein serine/threonine kinase activity; • calmodulin binding; • ATP binding; • protein kinase activity;
Клітинна компонента	• клітинна мембрана; • actin cytoskeleton; • цитоскелет; • цитоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• regulation of apoptotic process; • negative regulation of translation; • фосфорилювання; • negative regulation of apoptotic process; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • regulation of autophagy; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; • apoptotic signaling pathway; • protein autophosphorylation; • regulation of translation; • extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • GO:0097285 апоптоз; • regulation of NMDA receptor activity; • protein phosphorylation; • positive regulation of autophagy; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • cellular response to interferon-gamma; • cellular response to hydroperoxide;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1612
	69635
	ENSG00000196730
	ENSMUSG00000021559
	P53355
	Q80YE7
	NM_001288729; NM_001288730; NM_001288731; NM_004938
	NM_001285917; NM_029653; NM_134062
	NP_001275658; NP_001275659; NP_001275660; NP_004929
	NP_001272846; NP_083929; NP_598823
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DAPK1 (англ. Death associated protein kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 430 амінокислот, а молекулярна маса — 160 046^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTVFRQENVD	DYYDTGEELG	SGQFAVVKKC	REKSTGLQYA	AKFIKKRRTK
SSRRGVSRED	IEREVSILKE	IQHPNVITLH	EVYENKTDVI	LILELVAGGE
LFDFLAEKES	LTEEEATEFL	KQILNGVYYL	HSLQIAHFDL	KPENIMLLDR
NVPKPRIKII	DFGLAHKIDF	GNEFKNIFGT	PEFVAPEIVN	YEPLGLEADM
WSIGVITYIL	LSGASPFLGD	TKQETLANVS	AVNYEFEDEY	FSNTSALAKD
FIRRLLVKDP	KKRMTIQDSL	QHPWIKPKDT	QQALSRKASA	VNMEKFKKFA
ARKKWKQSVR	LISLCQRLSR	SFLSRSNMSV	ARSDDTLDEE	DSFVMKAIIH
AINDDNVPGL	QHLLGSLSNY	DVNQPNKHGT	PPLLIAAGCG	NIQILQLLIK
RGSRIDVQDK	GGSNAVYWAA	RHGHVDTLKF	LSENKCPLDV	KDKSGEMALH
VAARYGHADV	AQLLCSFGSN	PNIQDKEEET	PLHCAAWHGY	YSVAKALCEA
GCNVNIKNRE	GETPLLTASA	RGYHDIVECL	AEHGADLNAC	DKDGHIALHL
AVRRCQMEVI	KTLLSQGCFV	DYQDRHGNTP	LHVACKDGNM	PIVVALCEAN
CNLDISNKYG	RTPLHLAANN	GILDVVRYLC	LMGASVEALT	TDGKTAEDLA
RSEQHEHVAG	LLARLRKDTH	RGLFIQQLRP	TQNLQPRIKL	KLFGHSGSGK
TTLVESLKCG	LLRSFFRRRR	PRLSSTNSSR	FPPSPLASKP	TVSVSINNLY
PGCENVSVRS	RSMMFEPGLT	KGMLEVFVAP	THHPHCSADD	QSTKAIDIQN
AYLNGVGDFS	VWEFSGNPVY	FCCYDYFAAN	DPTSIHVVVF	SLEEPYEIQL
NQVIFWLSFL	KSLVPVEEPI	AFGGKLKNPL	QVVLVATHAD	IMNVPRPAGG
EFGYDKDTSL	LKEIRNRFGN	DLHISNKLFV	LDAGASGSKD	MKVLRNHLQE
IRSQIVSVCP	PMTHLCEKII	STLPSWRKLN	GPNQLMSLQQ	FVYDVQDQLN
PLASEEDLRR	IAQQLHSTGE	INIMQSETVQ	DVLLLDPRWL	CTNVLGKLLS
VETPRALHHY	RGRYTVEDIQ	RLVPDSDVEE	LLQILDAMDI	CARDLSSGTM
VDVPALIKTD	NLHRSWADEE	DEVMVYGGVR	IVPVEHLTPF	PCGIFHKVQV
NLCRWIHQQS	TEGDADIRLW	VNGCKLANRG	AELLVLLVNH	GQGIEVQVRG
LETEKIKCCL	LLDSVCSTIE	NVMATTLPGL	LTVKHYLSPQ	QLREHHEPVM
IYQPRDFFRA	QTLKETSLTN	TMGGYKESFS	SIMCFGCHDV	YSQASLGMDI
HASDLNLLTR	RKLSRLLDPP	DPLGKDWCLL	AMNLGLPDLV	AKYNTSNGAP
KDFLPSPLHA	LLREWTTYPE	STVGTLMSKL	RELGRRDAAD	FLLKASSVFK
INLDGNGQEA	YASSCNSGTS	YNSISSVVSR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, регуляція трансляції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою кальмодуліну, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Deiss L.P., Feinstein E., Berissi H., Cohen O., Kimchi A. (1995). Identification of a novel serine/threonine kinase and a novel 15-kD protein as potential mediators of the gamma interferon-induced cell death. Genes Dev. 9: 15—30. PMID 7828849 DOI:10.1101/gad.9.1.15
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Inbal B., Shani G., Cohen O., Kissil J.L., Kimchi A. (2000). Death-associated protein kinase-related protein 1, a novel serine/threonine kinase involved in apoptosis. Mol. Cell. Biol. 20: 1044—1054. PMID 10629061 DOI:10.1128/MCB.20.3.1044-1054.2000
Inbal B., Bialik S., Sabanay I., Shani G., Kimchi A. (2002). DAP kinase and DRP-1 mediate membrane blebbing and the formation of autophagic vesicles during programmed cell death. J. Cell Biol. 157: 455—468. PMID 11980920 DOI:10.1083/jcb.200109094
Tian J.H., Das S., Sheng Z.H. (2003). Ca2+-dependent phosphorylation of syntaxin-1A by the death-associated protein (DAP) kinase regulates its interaction with Munc18. J. Biol. Chem. 278: 26265—26274. PMID 12730201 DOI:10.1074/jbc.M300492200
Lee J.H., Rho S.B., Chun T. (2005). Programmed cell death 6 (PDCD6) protein interacts with death-associated protein kinase 1 (DAPk1): additive effect on apoptosis via caspase-3 dependent pathway. Biotechnol. Lett. 27: 1011—1015. PMID 16132846 DOI:10.1007/s10529-005-7869-x

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з DAPK1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Death associated protein kinase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2674 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, P53355 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з DAPK1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Death associated protein kinase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2674 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-6] UniProt, P53355 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[5]

[6]

[1]

[2]

[3]

[4]