CXCL16

CXCL16 (англ. C-X-C motif chemokine ligand 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 17-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 254 амінокислот, а молекулярна маса — 27 579.

CXCL16
Ідентифікатори
Символи	CXCL16, CXCLG16, SR-PSOX, SRPSOX, C-X-C motif chemokine ligand 16
Зовнішні ІД	OMIM: 605398 MGI: 1932682 HomoloGene: 49694 GeneCards: CXCL16
Онтологія гена Молекулярна функція • cytokine activity • chemokine activity • low-density lipoprotein particle receptor activity • scavenger receptor activity Клітинна компонента • клітинна мембрана • мембрана • extracellular region • integral component of membrane • міжклітинний простір Біологічний процес • lymphocyte chemotaxis • positive regulation of cell growth • positive regulation of cell migration • рецептор-опосередкований ендоцитоз • response to tumor necrosis factor • response to cytokine • response to interferon-gamma • хемотаксис • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • T cell chemotaxis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	58191	66102
Ensembl	ENSG00000161921	ENSMUSG00000018920
UniProt	Q9H2A7	Q8BSU2
RefSeq (мРНК)	NM_022059 NM_001100812 NM_001386809	NM_023158
RefSeq (білок)	NP_001094282 NP_071342	NP_075647
Локус (UCSC)	Хр. 17: 4.73 – 4.74 Mb	Хр. 11: 70.34 – 70.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRDLRPGSR		VLLLLLLLLL		VYLTQPGNGN		EGSVTGSCYC		GKRISSDSPP
SVQFMNRLRK		HLRAYHRCLY		YTRFQLLSWS		VCGGNKDPWV		QELMSCLDLK
ECGHAYSGIV		AHQKHLLPTS		PPISQASEGA		SSDIHTPAQM		LLSTLQSTQR
PTLPVGSLSS		DKELTRPNET		TIHTAGHSLA		AGPEAGENQK		QPEKNAGPTA
RTSATVPVLC		LLAIIFILTA		ALSYVLCKRR		RGQSPQSSPD		LPVHYIPVAP
DSNT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у такому біологічному процесі, як хемотаксис. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Matloubian M., David A., Engel S., Ryan J.E., Cyster J.G. (2000). A transmembrane CXC chemokine is a ligand for HIV-coreceptor Bonzo. Nat. Immunol. 1: 298—304. PMID 11017100 DOI:10.1038/79738
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17