CSF1

CSF1 (англ. Colony stimulating factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 554 амінокислот, а молекулярна маса — 60 179.

CSF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1HMC, 3UEZ, 3UF2, 4ADF, 4FA8, 4WRL, 4WRM
Ідентифікатори
Символи	CSF1, CSF-1, MCSF, colony stimulating factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 120420 MGI: 1339753 HomoloGene: 7282 GeneCards: CSF1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • macrophage colony-stimulating factor receptor binding • protein homodimerization activity • growth factor activity • cytokine activity • identical protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • perinuclear region of cytoplasm • CSF1-CSF1R complex • мембрана • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen • extracellular region • клітинна мембрана Біологічний процес • positive regulation of microglial cell migration • диференціація клітин • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process • mammary gland fat development • branching involved in mammary gland duct morphogenesis • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • процес імунної системи • positive regulation of Ras protein signal transduction • positive regulation of macrophage colony-stimulating factor signaling pathway • mammary duct terminal end bud growth • monocyte activation • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • macrophage colony-stimulating factor signaling pathway • positive regulation of odontogenesis of dentin-containing tooth • positive regulation of cell population proliferation • regulation of macrophage derived foam cell differentiation • positive regulation of multicellular organism growth • homeostasis of number of cells within a tissue • regulation of ossification • inflammatory response • positive regulation of macrophage chemotaxis • вроджений імунітет • positive regulation of mononuclear cell proliferation • osteoclast proliferation • positive regulation of osteoclast differentiation • positive regulation of cell migration • positive regulation of monocyte differentiation • positive regulation of protein kinase activity • developmental process involved in reproduction • positive regulation of cell-matrix adhesion • positive regulation of macrophage differentiation • проліферація • macrophage differentiation • посттрансляційна модифікація • regulation of signaling receptor activity • cytokine-mediated signaling pathway • кровотворення • osteoclast differentiation • response to ischemia • microglial cell proliferation • negative regulation of neuron death Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1435	12977
Ensembl	ENSG00000184371	ENSMUSG00000014599
UniProt	P09603	P07141
RefSeq (мРНК)	NM_172212 NM_000757 NM_172210 NM_172211	NM_001113529 NM_001113530 NM_007778
RefSeq (білок)	NP_000748 NP_757349 NP_757350 NP_757351	NP_001107001 NP_001107002 NP_031804
Локус (UCSC)	Хр. 1: 109.91 – 109.93 Mb	Хр. 3: 107.65 – 107.67 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTAPGAAGRC		PPTTWLGSLL		LLVCLLASRS		ITEEVSEYCS		HMIGSGHLQS
LQRLIDSQME		TSCQITFEFV		DQEQLKDPVC		YLKKAFLLVQ		DIMEDTMRFR
DNTPNAIAIV		QLQELSLRLK		SCFTKDYEEH		DKACVRTFYE		TPLQLLEKVK
NVFNETKNLL		DKDWNIFSKN		CNNSFAECSS		QDVVTKPDCN		CLYPKAIPSS
DPASVSPHQP		LAPSMAPVAG		LTWEDSEGTE		GSSLLPGEQP		LHTVDPGSAK
QRPPRSTCQS		FEPPETPVVK		DSTIGGSPQP		RPSVGAFNPG		MEDILDSAMG
TNWVPEEASG		EASEIPVPQG		TELSPSRPGG		GSMQTEPARP		SNFLSASSPL
PASAKGQQPA		DVTGTALPRV		GPVRPTGQDW		NHTPQKTDHP		SALLRDPPEP
GSPRISSLRP		QGLSNPSTLS		AQPQLSRSHS		SGSVLPLGEL		EGRRSTRDRR
SPAEPEGGPA		SEGAARPLPR		FNSVPLTDTG		HERQSEGSFS		PQLQESVFHL
LVPSVILVLL		AVGGLLFYRW		RRRSHQEPQR		ADSPLEQPEG		SPLTQDDRQV
ELPV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до цитокінів, факторів росту. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pampfer S., Tabibzadeh S., Chuan F.-C., Pollard J.W. (1991). Expression of colony-stimulating factor-1 (CSF-1) messenger RNA in human endometrial glands during the menstrual cycle: molecular cloning of a novel transcript that predicts a cell surface form of CSF-1. Mol. Endocrinol. 5: 1931—1938. PMID 1791839 DOI:10.1210/mend-5-12-1931
• Sakai N., Umeda T., Suzuki H., Ishimatsu Y., Shikita M. (1987). Macrophage colony-stimulating factor purified from normal human urine. Amino-terminal sequence and amino acid composition. FEBS Lett. 222: 341—344. PMID 3498652 DOI:10.1016/0014-5793(87)80398-8
• Rettenmier C.W., Roussel M.F. (1988). Differential processing of colony-stimulating factor 1 precursors encoded by two human cDNAs. Mol. Cell. Biol. 8: 5026—5034. PMID 3264877 DOI:10.1128/MCB.8.11.5026
• Glocker M.O., Arbogast B., Schreurs J., Deinzer M.L. (1993). Assignment of the inter- and intramolecular disulfide linkages in recombinant human macrophage colony stimulating factor using fast atom bombardment mass spectrometry. Biochemistry. 32: 482—488. PMID 8422357 DOI:10.1021/bi00053a012
• Pixley F.J., Stanley E.R. (2004). CSF-1 regulation of the wandering macrophage: complexity in action. Trends Cell Biol. 14: 628—638. PMID 15519852 DOI:10.1016/j.tcb.2004.09.016

Див. також

• Хромосома 1