CSDC2

CSDC2 (англ. Cold shock domain containing C2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 153 амінокислот, а молекулярна маса — 16 786.

CSDC2
Ідентифікатори
Символи	CSDC2, PIPPIN, dJ347H13.2, cold shock domain containing C2
Зовнішні ІД	OMIM: 617689 MGI: 2146027 HomoloGene: 8701 GeneCards: CSDC2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding • mRNA 3'-UTR binding • transcription factor binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма Біологічний процес • mRNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of mRNA stability Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27254	105859
Ensembl	ENSG00000172346	ENSMUSG00000042109
UniProt	Q9Y534	Q91YQ3
RefSeq (мРНК)	NM_014460	NM_145473
RefSeq (білок)	NP_055275	NP_663448
Локус (UCSC)	Хр. 22: 41.56 – 41.58 Mb	Хр. 15: 81.82 – 81.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSESTSPPV		VPPLHSPKSP		VWPTFPFHRE		GSRVWERGGV		PPRDLPSPLP
TKRTRTYSAT		ARASAGPVFK		GVCKQFSRSQ		GHGFITPENG		SEDIFVHVSD
IEGEYVPVEG		DEVTYKMCPI		PPKNQKFQAV		EVVLTQLAPH		TPHETWSGQV
VGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 22