CRY2

CRY2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4I6E, 4I6G, 4I6J, 4MLP, 4U8H
Ідентифікатори
Символи	CRY2, HPHLL2, cryptochrome circadian clock 2, cryptochrome circadian regulator 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603732 MGI: 1270859 HomoloGene: 56466 GeneCards: CRY2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• deoxyribodipyrimidine photo-lyase activity; • DNA binding; • nucleotide binding; • phosphatase binding; • blue light photoreceptor activity; • FAD binding; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • single-stranded DNA binding; • damaged DNA binding; • DNA (6-4) photolyase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • photoreceptor activity;
Клітинна компонента	• extracellular region; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • nuclear speck;
Біологічний процес	• negative regulation of glucocorticoid receptor signaling pathway; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • glucose homeostasis; • відповідь на стимул; • ритмічний процес; • negative regulation of circadian rhythm; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of sodium-dependent phosphate transport; • circadian regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • regulation of circadian rhythm; • negative regulation of phosphoprotein phosphatase activity; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • entrainment of circadian clock by photoperiod; • blue light signaling pathway; • photoreactive repair; • циркадний ритм; • response to light stimulus; • response to activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	1408
	12953
	ENSG00000121671
	ENSMUSG00000068742
	Q49AN0
	Q9R194
	NM_021117; NM_001127457
	NM_001113333; NM_009963
	NP_001120929; NP_066940
	NP_034093
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CRY2 (англ. Cryptochrome circadian clock 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 593 амінокислот, а молекулярна маса — 66 947^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAATVATAAA	VAPAPAPGTD	SASSVHWFRK	GLRLHDNPAL	LAAVRGARCV
RCVYILDPWF	AASSSVGINR	WRFLLQSLED	LDTSLRKLNS	RLFVVRGQPA
DVFPRLFKEW	GVTRLTFEYD	SEPFGKERDA	AIMKMAKEAG	VEVVTENSHT
LYDLDRIIEL	NGQKPPLTYK	RFQAIISRME	LPKKPVGLVT	SQQMESCRAE
IQENHDETYG	VPSLEELGFP	TEGLGPAVWQ	GGETEALARL	DKHLERKAWV
ANYERPRMNA	NSLLASPTGL	SPYLRFGCLS	CRLFYYRLWD	LYKKVKRNST
PPLSLFGQLL	WREFFYTAAT	NNPRFDRMEG	NPICIQIPWD	RNPEALAKWA
EGKTGFPWID	AIMTQLRQEG	WIHHLARHAV	ACFLTRGDLW	VSWESGVRVF
DELLLDADFS	VNAGSWMWLS	CSAFFQQFFH	CYCPVGFGRR	TDPSGDYIRR
YLPKLKAFPS	RYIYEPWNAP	ESIQKAAKCI	IGVDYPRPIV	NHAETSRLNI
ERMKQIYQQL	SRYRGLCLLA	SVPSCVEDLS	HPVAEPSSSQ	AGSMSSAGPR
PLPSGPASPK	RKLEAAEEPP	GEELSKRARV	AELPTPELPS	KDA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, хромофором, ФАД, флавопротеїном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Griffin E.A. Jr., Staknis D., Weitz C.J. (1999). Light-independent role of CRY1 and CRY2 in the mammalian circadian clock. Science. 286: 768—771. PMID 10531061 DOI:10.1126/science.286.5440.768
Partch C.L., Shields K.F., Thompson C.L., Selby C.P., Sancar A. (2006). Posttranslational regulation of the mammalian circadian clock by cryptochrome and protein phosphatase 5. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103: 10467—10472. PMID 16790549 DOI:10.1073/pnas.0604138103
Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 DOI:10.1152/physrev.00016.2012
Partch C.L., Green C.B., Takahashi J.S. (2014). Molecular architecture of the mammalian circadian clock. Trends Cell Biol. 24: 90—99. PMID 23916625 DOI:10.1016/j.tcb.2013.07.002

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2385 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.
↑ UniProt, Q49AN0 (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2385 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q49AN0 (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]