CPSF3

CPSF3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2I7T, 2I7V
Ідентифікатори
Символи	CPSF3, CPSF-73, CPSF73, cleavage and polyadenylation specific factor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606029 MGI: 1859328 HomoloGene: 6499 GeneCards: CPSF3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• 5'-3' exonuclease activity; • зв'язування з іоном металу; • endoribonuclease activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • nuclease activity; • endonuclease activity; • hydrolase activity;
Клітинна компонента	• mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex; • нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA 3'-end processing by stem-loop binding and cleavage; • mRNA processing; • mRNA export from nucleus; • mRNA polyadenylation; • mRNA cleavage; • mRNA 3'-end processing; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • sno(s)RNA 3'-end processing; • snoRNA splicing; • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	51692
	54451
	ENSG00000119203
	ENSMUSG00000054309
	Q9UKF6
	Q9QXK7
	NM_016207; NM_001321833; NM_001321834; NM_001321835; NM_001321836
	NM_018813; NM_001364372; NM_001364373
	NP_001308762; NP_001308763; NP_001308764; NP_001308765; NP_057291
	NP_061283; NP_001351301; NP_001351302
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CPSF3 (англ. Cleavage and polyadenylation specific factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 684 амінокислот, а молекулярна маса — 77 486^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSAIPAEESD	QLLIRPLGAG	QEVGRSCIIL	EFKGRKIMLD	CGIHPGLEGM
DALPYIDLID	PAEIDLLLIS	HFHLDHCGAL	PWFLQKTSFK	GRTFMTHATK
AIYRWLLSDY	VKVSNISADD	MLYTETDLEE	SMDKIETINF	HEVKEVAGIK
FWCYHAGHVL	GAAMFMIEIA	GVKLLYTGDF	SRQEDRHLMA	AEIPNIKPDI
LIIESTYGTH	IHEKREEREA	RFCNTVHDIV	NRGGRGLIPV	FALGRAQELL
LILDEYWQNH	PELHDIPIYY	ASSLAKKCMA	VYQTYVNAMN	DKIRKQININ
NPFVFKHISN	LKSMDHFDDI	GPSVVMASPG	MMQSGLSREL	FESWCTDKRN
GVIIAGYCVE	GTLAKHIMSE	PEEITTMSGQ	KLPLKMSVDY	ISFSAHTDYQ
QTSEFIRALK	PPHVILVHGE	QNEMARLKAA	LIREYEDNDE	VHIEVHNPRN
TEAVTLNFRG	EKLAKVMGFL	ADKKPEQGQR	VSGILVKRNF	NYHILSPCDL
SNYTDLAMST	VKQTQAIPYT	GPFNLLCYQL	QKLTGDVEEL	EIQEKPALKV
FKNITVIQEP	GMVVLEWLAN	PSNDMYADTV	TTVILEVQSN	PKIRKGAVQK
VSKKLEMHVY	SKRLEIMLQD	IFGEDCVSVK	DDSILSVTVD	GKTANLNLET
RTVECEEGSE	DDESLREMVE	LAAQRLYEAL	TPVH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рибонуклеопротеїнів, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, поліморфізм, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kaufmann I., Martin G., Friedlein A., Langen H., Keller W. (2004). Human Fip1 is a subunit of CPSF that binds to U-rich RNA elements and stimulates poly(A) polymerase. EMBO J. 23: 616—626. PMID 14749727 DOI:10.1038/sj.emboj.7600070
Ryan K., Calvo O., Manley J.L. (2004). Evidence that polyadenylation factor CPSF-73 is the mRNA 3' processing endonuclease. RNA. 10: 565—573. PMID 15037765 DOI:10.1261/rna.5214404
Vethantham V., Rao N., Manley J.L. (2007). Sumoylation modulates the assembly and activity of the pre-mRNA 3' processing complex. Mol. Cell. Biol. 27: 8848—8858. PMID 17923699 DOI:10.1128/MCB.01186-07
Kolev N.G., Yario T.A., Benson E., Steitz J.A. (2008). Conserved motifs in both CPSF73 and CPSF100 are required to assemble the active endonuclease for histone mRNA 3'-end maturation. EMBO Rep. 9: 1013—1018. PMID 18688255 DOI:10.1038/embor.2008.146
Laishram R.S., Anderson R.A. (2010). The poly A polymerase Star-PAP controls 3'-end cleavage by promoting CPSF interaction and specificity toward the pre-mRNA. EMBO J. 29: 4132—4145. PMID 21102410 DOI:10.1038/emboj.2010.287

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2326 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UKF6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2326 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UKF6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 вересня 2017. Процитовано 29 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]