CPNE5

CPNE5 (англ. Copine 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 593 амінокислот, а молекулярна маса — 65 734.

CPNE5
Ідентифікатори
Символи	CPNE5, COPN5, CPN5, copine 5
Зовнішні ІД	OMIM: 604209 MGI: 2385908 HomoloGene: 23266 GeneCards: CPNE5
Онтологія гена Молекулярна функція • молекулярна функція • calcium-dependent phospholipid binding Клітинна компонента • neuron projection • перикаріон • neuronal cell body • cell projection • екзосома • клітинна мембрана Біологічний процес • positive regulation of dendrite extension • диференціація клітин • cellular response to calcium ion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57699	240058
Ensembl	ENSG00000124772	ENSMUSG00000024008
UniProt	Q9HCH3	Q8JZW4
RefSeq (мРНК)	NM_001314017 NM_001314018 NM_001314019 NM_001314020 NM_020939 NM_001376888 NM_001376889 NM_001376890 NM_001376891 NM_001376892 NM_001376893 NM_001376894 NM_001376895	NM_153166 NM_001360239
RefSeq (білок)	NP_001300946 NP_001300947 NP_001300948 NP_001300949 NP_065990 NP_001363817 NP_001363818 NP_001363819 NP_001363820 NP_001363821 NP_001363822 NP_001363823 NP_001363824	NP_694806 NP_001347168
Локус (UCSC)	Хр. 6: 36.74 – 36.84 Mb	Хр. 17: 29.37 – 29.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEQPEDMASL		SEFDSLAGSI		PATKVEITVS		CRNLLDKDMF		SKSDPLCVMY
TQGMENKQWR		EFGRTEVIDN		TLNPDFVRKF		IVDYFFEEKQ		NLRFDLYDVD
SKSPDLSKHD		FLGQAFCTLG		EIVGSPGSRL		EKPLTIGAFS		LNSRTGKPMP
AVSNGGVPGK		KCGTIILSAE		ELSNCRDVAT		MQFCANKLDK		KDFFGKSDPF
LVFYRSNEDG		TFTICHKTEV		MKNTLNPVWQ		TFSIPVRALC		NGDYDRTIKV
EVYDWDRDGS		HDFIGEFTTS		YRELARGQSQ		FNIYEVVNPK		KKMKKKKYVN
SGTVTLLSFA		VESECTFLDY		IKGGTQINFT		VAIDFTASNG		NPSQSTSLHY
MSPYQLNAYA		LALTAVGEII		QHYDSDKMFP		ALGFGAKLPP		DGRVSHEFPL
NGNQENPSCC		GIDGILEAYH		RSLRTVQLYG		PTNFAPVVTH		VARNAAAVQD
GSQYSVLLII		TDGVISDMAQ		TKEAIVNAAK		LPMSIIIVGV		GQAEFDAMVE
LDGDDVRISS		RGKLAERDIV		QFVPFRDYVD		RTGNHVLSMA		RLARDVLAEI
PDQLVSYMKA		QGIRPRPPPA		APTHSPSQSP		ARTPPASPLH		THI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинних відростках.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6