COPS2

COPS2 (англ. COP9 signalosome subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 443 амінокислот, а молекулярна маса — 51 597.

COPS2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4D10, 4D18, 4WSN
Ідентифікатори
Символи	COPS2, ALIEN, CSN2, SGN2, TRIP15, COP9 signalosome subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604508 MGI: 1330276 HomoloGene: 134283 GeneCards: COPS2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signal transducer activity • GO:0001106 transcription corepressor activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • COP9 signalosome • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • neuron differentiation • проліферація • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • skeletal muscle cell differentiation • transcription-coupled nucleotide-excision repair • Нейрогенез • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • protein deneddylation • посттрансляційна модифікація • protein phosphorylation • inner cell mass cell proliferation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9318	12848
Ensembl	ENSG00000166200	ENSMUSG00000027206
UniProt	P61201	P61202
RefSeq (мРНК)	NM_004236 NM_001143887	NM_001285507 NM_001285512 NM_001285513 NM_009939
RefSeq (білок)	NP_001137359 NP_004227	NP_001272436 NP_001272441 NP_001272442 NP_034069
Локус (UCSC)	Хр. 15: 49.11 – 49.16 Mb	Хр. 2: 125.67 – 125.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDMEDDFMC		DDEEDYDLEY		SEDSNSEPNV		DLENQYYNSK		ALKEDDPKAA
LSSFQKVLEL		EGEKGEWGFK		ALKQMIKINF		KLTNFPEMMN		RYKQLLTYIR
SAVTRNYSEK		SINSILDYIS		TSKQMDLLQE		FYETTLEALK		DAKNDRLWFK
TNTKLGKLYL		EREEYGKLQK		ILRQLHQSCQ		TDDGEDDLKK		GTQLLEIYAL
EIQMYTAQKN		NKKLKALYEQ		SLHIKSAIPH		PLIMGVIREC		GGKMHLREGE
FEKAHTDFFE		AFKNYDESGS		PRRTTCLKYL		VLANMLMKSG		INPFDSQEAK
PYKNDPEILA		MTNLVSAYQN		NDITEFEKIL		KTNHSNIMDD		PFIREHIEEL
LRNIRTQVLI		KLIKPYTRIH		IPFISKELNI		DVADVESLLV		QCILDNTIHG
RIDQVNQLLE		LDHQKRGGAR		YTALDKWTNQ		LNSLNQAVVS		KLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee J.W., Choi H.-S., Gyuris J., Brent R., Moore D.D. (1995). Two classes of proteins dependent on either the presence or absence of thyroid hormone for interaction with the thyroid hormone receptor. Mol. Endocrinol. 9: 243—254. PMID 7776974 DOI:10.1210/mend.9.2.7776974

Див. також

• Хромосома 15