COL6A5

COL6A5
Ідентифікатори
Символи	COL6A5, collagen, type VI, alpha 5, COL29A1, VWA4, collagen type VI alpha 5, collagen type VI alpha 5 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 611916 MGI: 3648134 HomoloGene: 122792 GeneCards: COL6A5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength;
Клітинна компонента	• колаген; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • extracellular region; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• адгезія клітин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	256076
	665033
	ENSG00000172752
	ENSMUSG00000091345
	A8TX70; H0Y935
	A6H584
	NM_001278298; NM_153264
	NM_001167923
	NP_001265227; NP_694996
	NP_001161395
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COL6A5 (англ. Collagen type VI alpha 5 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 615 амінокислот, а молекулярна маса — 289 926^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKILLIIFVL	IIWTETLADQ	SPGPGPVYAD	VVFLVDSSDH	LGPKSFPFVK
TFINKMINSL	PIEANKYRVA	LAQYSDEFHS	EFHLSTFKGR	SPMLNHLKKN
FQFIGGSLQI	GKALQEAHRT	YFSAPINGRD	RKQFPPILVV	LASAESEDEV
EEASKALQKD	GVKIISVGVQ	KASEENLKAM	ATSHFHFNLR	TIRDLSTFSQ
NMTQIIKDVT	KYKEGAVDAD	MQVHFPISCQ	KDSLADLVFL	VDESLGTGGN
LRHLQTFLEN	ITSSMDVKEN	CMRLGLMSYS	NSAKTISFLK	SSTTQSEFQQ
QIKNLSIQVG	KSNTGAAIDQ	MRRDGFSESY	GSRRAQGVPQ	IAVLVTHRPS
DDEVHDAALN	LRLEDVNVFA	LSIQGANNTQ	LEEIVSYPPE	QTISTLKSYA
DLETYSTKFL	KKLQNEIWSQ	ISTYAEQRNL	DKTGCVDTKE	ADIHFLIDGS
SSIQEKQFEQ	IKRFMLEVTE	MFSIGPDKVR	VGVVQYSDDT	EVEFYITDYS
NDIDLRKAIF	NIKQLTGGTY	TGKALDYILQ	IIKNGMKDRM	SKVPCYLIVL
TDGMSTDRVV	EPAKRLRAEQ	ITVHAVGIGA	ANKIELQEIA	GKEERVSFGQ
NFDALKSIKN	EVVREICAEK	GCEDMKADIM	FLVDSSWSIG	NENFRKMKIF
MKNLLTKIQI	GADKTQIGVV	QFSDKTKEEF	QLNRYFTQQE	ISDAIDRMSL
INEGTLTGKA	LNFVGQYFTH	SKGARLGAKK	FLILITDGVA	QDDVRDPARI
LRGKDVTIFS	VGVYNANRSQ	LEEISGDSSL	VFHVENFDHL	KALERKLIFR
VCALHDCKRI	TLLDVVFVLD	HSGSIKKQYQ	DHMINLTIHL	VKKADVGRDR
VQFGALKYSD	QPNILFYLNT	YSNRSAIIEN	LRKRRDTGGN	TYTAKALKHA
NALFTEEHGS	RIKQNVKQML	IVITDGESHD	HDQLNDTALE	LRNKGITIFA
VGVGKANQKE	LEGMAGNKNN	TIYVDNFDKL	KDVFTLVQER	MCTEAPEVCH
LQEADVIFLC	DGSDRVSNSD	FVTMTTFLSD	LIDNFDIQSQ	RMKIGMAQFG
SNYQSIIELK	NSLTKTQWKT	QIQNVSKSGG	FPRIDFALKK	VSNMFNLHAG
GRRNAGVPQT	LVVITSGDPR	YDVADAVKTL	KDLGICVLVL	GIGDVYKEHL
LPITGNSEKI	ITFQDFDKLK	NVDVKKRIIR	EICQSCGKTN	CFMDIVVGFD
ISTHVQGQPL	FQGHPQLESY	LPGILEDISS	IKGVSCGAGT	EAQVSLAFKV
NSDQGFPAKF	QIYQKAVFDS	LLQVNVSGPT	HLNAQFLRSL	WDTFKDKSAS
RGQVLLIFSD	GLQSESNIML	ENQSDRLREA	GLDALLVVSL	NTTAHHEFSS
FEFGKRFDYR	THLTIGMREL	GKKLSQYLGN	IAERTCCCTF	CKCPGIPGPH
GTRGLQAMKG	SQGLKGSRGH	RGEDGNPGVR	GDTGPQGDKG	IAGCPGAWGQ
KGLKGFSGPK	GGHGDDGIDG	LDGEEGCHGF	PGIKGEKGDP	GSQGSPGSRG
APGQYGEKGF	PGDPGNPGQN	NNIKGQKGSK	GEQGRQGRSG	QKGVQGSPSS
RGSRGREGQR	GLRGVSGEPG	NPGPTGTLGA	EGLQGPQGSQ	GNPGRKGEKG
SQGQKGPQGS	PGLMGAKGST	GRPGLLGKKG	EPGLPGDLGP	VGQTGQRGRQ
GDSGIPGYGQ	MGRKGVKGPR	GFPGDAGQKG	DIGNPGIPGG	PGPKGFRGLA
LTVGLKGEEG	SRGLPGPPGQ	RGIKGMAGQP	VYSQCDLIRF	LREHSPCWKE
KCPAYPTELV	FALDNSYDVT	EESFNKTRDI	ITSIVNDLNI	RENNCPVGAR
VAMVSYNSGT	SYLIRWSDYN	RKKQLLQQLS	QIKYQDTTEP	RDVGNAMRFV
TRNVFKRTYA	GANVRRVAVF	FSNGQTASRS	SIITATMEFS	ALDISPTVFA
FDERVFLEAF	GFDNTGTFQV	IPVPPNGENQ	TLERLRRCAL	CYDKCFPNAC
IREAFLPEDS	YMDVVFLIDN	SRNIAKDEFK	AVKALVSSVI	DNFNIASDPL
ISDSGDRIAL	LSYSPWESSR	RKMGTVKTEF	DFITYDNQLL	MKNHIQTSFQ
QLNGEATIGR	ALLWTTENLF	PETPYLRKHK	VIFVVSAGEN	YERKEFVKMM
ALRAKCQGYV	IFVISLGSTR	KDDMEELASY	PLDQHLIQLG	RIHKPDLNYI
AKFLKPFLYS	VRRGFNQYPP	PMLEDACRLI	NLGGENIQND	GFQFVTELQE
DFLGGNGFIG	QELNSGRESP	FVKTEDNGSD	YLVYLPSQMF	EPQKLMINYE
KDQKSAEIAS	LTSGHENYGR	KEEPDHTYEP	GDVSLQEYYM	DVAFLIDASQ
RVGSDEFKEV	KAFITSVLDY	FHIAPTPLTS	TLGDRVAVLS	YSPPGYMPNT
EECPVYLEFD	LVTYNSIHQM	KHHLQDSQQL	NGDVFIGHAL	QWTIDNVFVG
TPNLRKNKVI	FVISAGETNS	LDKDVLRNVS	LRAKCQGYSI	FVFSFGPKHN
DKELEELASH	PLDHHLVQLG	RTHKPDWNYI	IKFVKPFVHL	IRRAINKYPT
EDMKATCVNM	TSPNPENGGT	ENTVLLLPGI	YEIKTENGDL	FDEFDSQAQH
LLVLGNNHSS	GSETATDLMQ	KLYLLFSTEK	LAMKDKEKAH	LEEISALVVD
KQQEKEDKEM	EATDI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26674 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, A8TX70 (англ.) . Архів оригіналу за 2 березня 2018. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:26674 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017.

[UniProt-4] UniProt, A8TX70 (англ.) . Архів оригіналу за 2 березня 2018. Процитовано 30 серпня 2017.

[3]

[4]

[1]

[2]