COL27A1
білок людини
COL27A1 (англ. Collagen type XXVII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 860 амінокислот, а молекулярна маса — 186 892[6].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MGAGSARGAR | GTAAAAAARG | GGFLFSWILV | SFACHLASTQ | GAPEDVDILQ | ||||
| RLGLSWTKAG | SPAPPGVIPF | QSGFIFTQRA | RLQAPTGTVI | PAALGTELAL | ||||
| VLSLCSHRVN | HAFLFAVRSQ | KRKLQLGLQF | LPGKTVVHLG | SRRSVAFDLD | ||||
| MHDGRWHHLA | LELRGRTVTL | VTACGQRRVP | VLLPFHRDPA | LDPGGSFLFG | ||||
| KMNPHAVQFE | GALCQFSIYP | VTQVAHNYCT | HLRKQCGQAD | TYQSPLGPLF | ||||
| SQDSGRPFTF | QSDLALLGLE | NLTTATPALG | SLPAGRGPRG | TVAPATPTKP | ||||
| QRTSPTNPHQ | HMAVGGPAQT | PLLPAKLSAS | NALDPMLPAS | VGGSTRTPRP | ||||
| AAAQPSQKIT | ATKIPKSLPT | KPSAPSTSIV | PIKSPHPTQK | TAPSSFTKSA | ||||
| LPTQKQVPPT | SRPVPARVSR | PAEKPIQRNP | GMPRPPPPST | RPLPPTTSSS | ||||
| KKPIPTLART | EAKITSHASK | PASARTSTHK | PPPFTALSSS | PAPTPGSTRS | ||||
| TRPPATMVPP | TSGTSTPRTA | PAVPTPGSAP | TGSKKPIGSE | ASKKAGPKSS | ||||
| PRKPVPLRPG | KAARDVPLSD | LTTRPSPRQP | QPSQQTTPAL | VLAPAQFLSS | ||||
| SPRPTSSGYS | IFHLAGSTPF | PLLMGPPGPK | GDCGLPGPPG | LPGLPGIPGA | ||||
| RGPRGPPGPY | GNPGLPGPPG | AKGQKGDPGL | SPGKAHDGAK | GDMGLPGLSG | ||||
| NPGPPGRKGH | KGYPGPAGHP | GEQGQPGPEG | SPGAKGYPGR | QGLPGPVGDP | ||||
| GPKGSRGYIG | LPGLFGLPGS | DGERGLPGVP | GKRGKMGMPG | FPGVFGERGP | ||||
| PGLDGNPGEL | GLPGPPGVPG | LIGDLGVLGP | IGYPGPKGMK | GLMGSVGEPG | ||||
| LKGDKGEQGV | PGVSGDPGFQ | GDKGSQGLPG | FPGARGKPGP | LGKVGDKGSI | ||||
| GFPGPPGPEG | FPGDIGPPGD | NGPEGMKGKP | GARGLPGPRG | QLGPEGDEGP | ||||
| MGPPGAPGLE | GQPGRKGFPG | RPGLDGVKGE | PGDPGRPGPV | GEQGFMGFIG | ||||
| LVGEPGIVGE | KGDRGMMGPP | GVPGPKGSMG | HPGMPGGMGT | PGEPGPQGPP | ||||
| GSRGPPGMRG | AKGRRGPRGP | DGPAGEQGSR | GLKGPPGPQG | RPGRPGQQGV | ||||
| AGERGHLGSR | GFPGIPGPSG | PPGTKGLPGE | PGPQGPQGPI | GPPGEMGPKG | ||||
| PPGAVGEPGL | PGEAGMKGDL | GPLGTPGEQG | LIGQRGEPGL | EGDSGPMGPD | ||||
| GLKGDRGDPG | PDGEHGEKGQ | EGLMGEDGPP | GPPGVTGVRG | PEGKSGKQGE | ||||
| KGRTGAKGAK | GYQGQLGEMG | VPGDPGPPGT | PGPKGSRGSL | GPTGAPGRMG | ||||
| AQGEPGLAGY | DGHKGIVGPL | GPPGPKGEKG | EQGEDGKAEG | PPGPPGDRGP | ||||
| VGDRGDRGEP | GDPGYPGQEG | VQGLRGKPGQ | QGQPGHPGPR | GWPGPKGSKG | ||||
| AEGPKGKQGK | AGAPGRRGVQ | GLQGLPGPRG | VVGRQGLEGI | AGPDGLPGRD | ||||
| GQAGQQGEQG | DDGDPGPMGP | AGKRGNPGVA | GLPGAQGPPG | FKGESGLPGQ | ||||
| LGPPGKRGTE | GRTGLPGNQG | EPGSKGQPGD | SGEMGFPGMA | GLFGPKGPPG | ||||
| DIGFKGIQGP | RGPPGLMGKE | GIVGPLGILG | PSGLPGPKGD | KGSRGDWGLQ | ||||
| GPRGPPGPRG | RPGPPGPPGG | PIQLQQDDLG | AAFQTWMDTS | GALRPESYSY | ||||
| PDRLVLDQGG | EIFKTLHYLS | NLIQSIKTPL | GTKENPARVC | RDLMDCEQKM | ||||
| VDGTYWVDPN | LGCSSDTIEV | SCNFTHGGQT | CLKPITASKV | EFAISRVQMN | ||||
| FLHLLSSEVT | QHITIHCLNM | TVWQEGTGQT | PAKQAVRFRA | WNGQIFEAGG | ||||
| QFRPEVSMDG | CKVQDGRWHQ | TLFTFRTQDP | QQLPIISVDN | LPPASSGKQY | ||||
| RLEVGPACFL |
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
ред.- Pace J.M., Corrado M., Missero C., Byers P.H. (2003). Identification, characterization and expression analysis of a new fibrillar collagen gene, COL27A1. Matrix Biol. 22: 3—14. PMID 12714037 DOI:10.1016/S0945-053X(03)00007-6
- Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Примітки
ред.- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL27A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL27A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:22986 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q8IZC6 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.
Див. також
ред.
|
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |