COL25A1

COL25A1 (англ. Collagen type XXV alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 654 амінокислот, а молекулярна маса — 64 771.

COL25A1
Ідентифікатори
Символи	COL25A1, AMY, CLAC, CLAC-P, CLACP, CFEOM5, Collagen, type XXV, alpha 1, collagen type XXV alpha 1, collagen type XXV alpha 1 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 610004 MGI: 1924268 HomoloGene: 57111 GeneCards: COL25A1
Онтологія гена Молекулярна функція • heparin binding • amyloid-beta binding • extracellular matrix structural constituent • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength Клітинна компонента • integral component of membrane • extracellular region • клітинна мембрана • Колаген • endoplasmic reticulum lumen • мембрана • міжклітинний простір • integral component of plasma membrane • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • axonogenesis involved in innervation • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84570	77018
Ensembl	ENSG00000188517	ENSMUSG00000058897
UniProt	Q9BXS0	Q99MQ5
RefSeq (мРНК)	NM_001256074 NM_032518 NM_198721	NM_001244952 NM_029838 NM_198711
RefSeq (білок)	NP_001243003 NP_115907 NP_942014	NP_001231881 NP_084114 NP_942004
Локус (UCSC)	Хр. 4: 108.81 – 109.3 Mb	Хр. 3: 129.93 – 130.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLKKHAGKG		GGREPRSEDP		TPAEQHCART		MPPCAVLAAL		LSVVAVVSCL
YLGVKTNDLQ		ARIAALESAK		GAPSIHLLPD		TLDHLKTMVQ		EKVERLLAQK
SYEHMAKIRI		AREAPSECNC		PAGPPGKRGK		RGRRGESGPP		GQPGPQGPPG
PKGDKGEQGD		QGPRMVFPKI		NHGFLSADQQ		LIKRRLIKGD		QGQAGPPGPP
GPPGPRGPPG		DTGKDGPRGM		PGVPGEPGKP		GEQGLMGPLG		PPGQKGSIGA
PGIPGMNGQK		GEPGLPGAVG		QNGIPGPKGE		PGEQGEKGDA		GENGPKGDTG
EKGDPGSSAA		GIKGEPGESG		RPGQKGEPGL		PGLPGLPGIK		GEPGFIGPQG
EPGLPGLPGT		KGERGEAGPP		GRGERGEPGA		PGPKGKQGES		GTRGPKGSKG
DRGEKGDSGA		QGPRGPPGQK		GDQGATEIID		YNGNLHEALQ		RITTLTVTGP
PGPPGPQGLQ		GPKGEQGSPG		IPGMDGEQGL		KGSKGDMGDP		GMTGEKGGIG
LPGLPGANGM		KGEKGDSGMP		GPQGPSIIGP		PGPPGPHGPP		GPMGPHGLPG
PKGTDGPMGP		HGPAGPKGER		GEKGAMGEPG		PRGPYGLPGK		DGEPGLDGFP
GPRGEKGDLG		EKGEKGFRGV		KGEKGEPGQP		GLDGLDAPCQ		LGPDGLPMPG
CWQK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Локалізований у мембрані.

Див. також

• Хромосома 4